Ignore:
Timestamp:
Aug 2, 2017, 9:56:13 PM (8 years ago)
Author:
Frederik Heber <frederik.heber@…>
Branches:
ForceAnnealing_with_BondGraph_continued
Children:
fcc860
Parents:
bef5b3
Message:

tempcommit: Fixes to Python tests due to changed anneal() and modified way of trajectory steps usage.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • tests/Python/ForceAnnealing/post/five_carbon_test_no-bondgraph.data

    rbef5b3 r93fd2a6  
    22# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    33C       1       6       10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
    4 C       2       7.6     10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
    5 C       3       8.7     10      10      0       0       0       0       0       0       2       4       0       0       
    6 C       4       10.8    10      10      0       0       0       0       0       0       3       5       0       0       
     4C       2       7.6     10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       1       3       0       0       
     5C       3       8.7     10      10      0       0       0       0.529177        0       0       2       4       0       0       
     6C       4       10.8    10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       3       5       0       0       
    77C       5       12.4    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
    88# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    9 C       1       6       10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
    10 C       2       7.57354 10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       1       3       0       0       
    11 C       3       8.75292 10      10      0       0       0       0.529177        0       0       2       4       0       0       
    12 C       4       10.7735 10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       3       5       0       0       
    13 C       5       12.4    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
     9C       1       6       10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
     10C       2       7.57354 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
     11C       3       8.75292 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
     12C       4       10.7735 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
     13C       5       12.4    10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
    1414# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    15 C       1       5.9986  10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
    16 C       2       7.54708 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
    17 C       3       8.80584 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
    18 C       4       10.7471 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
    19 C       5       12.3986 10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
     15C       1       5.9986  10      10      0       0       0       -0.065401       0       0       2       0       0       0       
     16C       2       7.47501 10      10      0       0       0       0.0432973       0       0       1       3       0       0       
     17C       3       9.03324 10      10      0       0       0       0.0442551       0       0       2       4       0       0       
     18C       4       10.6751 10      10      0       0       0       0.043202        0       0       3       5       0       0       
     19C       5       12.3986 10      10      0       0       0       -0.0653534      0       0       4       0       0       0       
    2020# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    21 C       1       5.9972  10      10      0       0       0       -0.0272632      0       0       2       0       0       0       
    22 C       2       7.51063 10      10      0       0       0       -0.153313       0       0       1       3       0       0       
    23 C       3       8.91959 10      10      0       0       0       0.361163        0       0       2       4       0       0       
    24 C       4       10.7106 10      10      0       0       0       -0.153334       0       0       3       5       0       0       
    25 C       5       12.3972 10      10      0       0       0       -0.0272526      0       0       4       0       0       0       
     21C       1       5.99682 10      10      0       0       0       -0.0555001      0       0       2       0       0       0       
     22C       2       7.49194 10      10      0       0       0       0.0408101       0       0       1       3       0       0       
     23C       3       9.06418 10      10      0       0       0       0.0294117       0       0       2       4       0       0       
     24C       4       10.692  10      10      0       0       0       0.0407361       0       0       3       5       0       0       
     25C       5       12.3968 10      10      0       0       0       -0.0554578      0       0       4       0       0       0       
    2626# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    27 C       1       5.99518 10      10      0       0       0       -0.0458109      0       0       2       0       0       0       
    28 C       2       7.49748 10      10      0       0       0       -0.0552831      0       0       1       3       0       0       
    29 C       3       9.01424 10      10      0       0       0       0.202172        0       0       2       4       0       0       
    30 C       4       10.6975 10      10      0       0       0       -0.0552514      0       0       3       5       0       0       
    31 C       5       12.3952 10      10      0       0       0       -0.0458267      0       0       4       0       0       0       
     27C       1       5.98683 10      10      0       0       0       0.0968606       0       0       2       0       0       0       
     28C       2       7.76987 10      10      0       0       0       -0.226176       0       0       1       3       0       0       
     29C       3       9.1255  10      10      0       0       0       0.259281        0       0       2       4       0       0       
     30C       4       10.9711 10      10      0       0       0       -0.227493       0       0       3       5       0       0       
     31C       5       12.3868 10      10      0       0       0       0.0975274       0       0       4       0       0       0       
    3232# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    33 C       1       5.99092 10      10      0       0       0       -0.0517006      0       0       2       0       0       0       
    34 C       2       7.49786 10      10      0       0       0       0.0076519       0       0       1       3       0       0       
    35 C       3       9.04478 10      10      0       0       0       0.088108        0       0       2       4       0       0       
    36 C       4       10.6979 10      10      0       0       0       0.00764132      0       0       3       5       0       0       
    37 C       5       12.3909 10      10      0       0       0       -0.0517006      0       0       4       0       0       0       
     33C       1       5.99167 10      10      0       0       0       -0.0302901      0       0       2       0       0       0       
     34C       2       7.53443 10      10      0       0       0       0.0621625       0       0       1       3       0       0       
     35C       3       9.19466 10      10      0       0       0       -0.0637606      0       0       2       4       0       0       
     36C       4       10.7344 10      10      0       0       0       0.0622101       0       0       3       5       0       0       
     37C       5       12.3917 10      10      0       0       0       -0.0303219      0       0       4       0       0       0       
    3838# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    39 C       1       5.92974 10      10      0       0       0       -0.0492452      0       0       2       0       0       0       
    40 C       2       7.49797 10      10      0       0       0       0.0211565       0       0       1       3       0       0       
    41 C       3       9.05654 10      10      0       0       0       0.0561986       0       0       2       4       0       0       
    42 C       4       10.698  10      10      0       0       0       0.0211036       0       0       3       5       0       0       
    43 C       5       12.3288 10      10      0       0       0       -0.0492135      0       0       4       0       0       0       
     39C       1       5.99092 10      10      0       0       0       -0.00303219     0       0       2       0       0       0       
     40C       2       7.58519 10      10      0       0       0       0.000820225     0       0       1       3       0       0       
     41C       3       9.18101 10      10      0       0       0       0.00442921      0       0       2       4       0       0       
     42C       4       10.7852 10      10      0       0       0       0.000799058     0       0       3       5       0       0       
     43C       5       12.3909 10      10      0       0       0       -0.00301631     0       0       4       0       0       0       
    4444# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    45 C       1       5.90026 10      10      0       0       0       -0.016812       0       0       2       0       0       0       
    46 C       2       7.49784 10      10      0       0       0       -0.00511185     0       0       1       3       0       0       
    47 C       3       9.0682  10      10      0       0       0       0.0438635       0       0       2       4       0       0       
    48 C       4       10.6978 10      10      0       0       0       -0.00564103     0       0       3       5       0       0       
    49 C       5       12.3002 10      10      0       0       0       -0.0162987      0       0       4       0       0       0       
     45C       1       5.99083 10      10      0       0       0       -0.00263001     0       0       2       0       0       0       
     46C       2       7.58586 10      10      0       0       0       8.99601e-05     0       0       1       3       0       0       
     47C       3       9.18106 10      10      0       0       0       0.00510127      0       0       2       4       0       0       
     48C       4       10.7859 10      10      0       0       0       3.17506e-05     0       0       3       5       0       0       
     49C       5       12.3908 10      10      0       0       0       -0.00259297     0       0       4       0       0       0       
    5050# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    51 C       1       5.89948 10      10      0       0       0       -0.00128061     0       0       2       0       0       0       
    52 C       2       7.49779 10      10      0       0       0       -0.0144042      0       0       1       3       0       0       
    53 C       3       9.0829  10      10      0       0       0       0.0313485       0       0       2       4       0       0       
    54 C       4       10.6978 10      10      0       0       0       -0.0143936      0       0       3       5       0       0       
    55 C       5       12.2995 10      10      0       0       0       -0.00127003     0       0       4       0       0       0       
     51C       1       5.99028 10      10      0       0       0       -0.00229134     0       0       2       0       0       0       
     52C       2       7.58595 10      10      0       0       0       -7.40848e-05    0       0       1       3       0       0       
     53C       3       9.18148 10      10      0       0       0       0.00470439      0       0       2       4       0       0       
     54C       4       10.7859 10      10      0       0       0       -1.05835e-05    0       0       3       5       0       0       
     55C       5       12.3903 10      10      0       0       0       -0.00232838     0       0       4       0       0       0       
    5656# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    57 C       1       5.89943 10      10      0       0       0       -0.00089431     0       0       2       0       0       0       
    58 C       2       7.4976  10      10      0       0       0       -0.00698514     0       0       1       3       0       0       
    59 C       3       9.09115 10      10      0       0       0       0.0157642       0       0       2       4       0       0       
    60 C       4       10.6975 10      10      0       0       0       -0.00698514     0       0       3       5       0       0       
    61 C       5       12.2994 10      10      0       0       0       -0.000899601    0       0       4       0       0       0       
     57C       1       5.98655 10      10      0       0       0       -0.000317506    0       0       2       0       0       0       
     58C       2       7.58595 10      10      0       0       0       0.000587387     0       0       1       3       0       0       
     59C       3       9.18646 10      10      0       0       0       -0.00056622     0       0       2       4       0       0       
     60C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000243422     0       0       3       5       0       0       
     61C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    6262# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    63 C       1       5.8993  10      10      0       0       0       -0.000968394    0       0       2       0       0       0       
    64 C       2       7.49756 10      10      0       0       0       -0.0024448      0       0       1       3       0       0       
    65 C       3       9.09342 10      10      0       0       0       0.00677347      0       0       2       4       0       0       
    66 C       4       10.6974 10      10      0       0       0       -0.00235484     0       0       3       5       0       0       
    67 C       5       12.2993 10      10      0       0       0       -0.00100544     0       0       4       0       0       0       
     63C       1       5.98596 10      10      0       0       0       -5.29177e-06    0       0       2       0       0       0       
     64C       2       7.58595 10      10      0       0       0       0.000275172     0       0       1       3       0       0       
     65C       3       9.18646 10      10      0       0       0       -0.00056622     0       0       2       4       0       0       
     66C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000243422     0       0       3       5       0       0       
     67C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    6868# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    69 C       1       5.89452 10      10      0       0       0       -0.000920768    0       0       2       0       0       0       
    70 C       2       7.49755 10      10      0       0       0       -0.00127003     0       0       1       3       0       0       
    71 C       3       9.09428 10      10      0       0       0       0.00429692      0       0       2       4       0       0       
    72 C       4       10.6974 10      10      0       0       0       -0.00110069     0       0       3       5       0       0       
    73 C       5       12.2977 10      10      0       0       0       -0.00100544     0       0       4       0       0       0       
     69C       1       5.98595 10      10      0       0       0       -9.48677e-21    0       0       2       0       0       0       
     70C       2       7.58595 10      10      0       0       0       0.00026988      0       0       1       3       0       0       
     71C       3       9.18646 10      10      0       0       0       -0.00056622     0       0       2       4       0       0       
     72C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000243422     0       0       3       5       0       0       
     73C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    7474# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    75 C       1       5.89454 10      10      0       0       0       0.00160341      0       0       2       0       0       0       
    76 C       2       7.49752 10      10      0       0       0       -0.00333382     0       0       1       3       0       0       
    77 C       3       9.09513 10      10      0       0       0       0.00338144      0       0       2       4       0       0       
    78 C       4       10.6974 10      10      0       0       0       -0.00149228     0       0       3       5       0       0       
    79 C       5       12.2974 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
     75C       1       5.98595 10      10      0       0       0       4.23342e-05     0       0       2       0       0       0       
     76C       2       7.58603 10      10      0       0       0       0.000185212     0       0       1       3       0       0       
     77C       3       9.18646 10      10      0       0       0       -0.000523885    0       0       2       4       0       0       
     78C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000243422     0       0       3       5       0       0       
     79C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    8080# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    81 C       1       5.89456 10      10      0       0       0       0.00157695      0       0       2       0       0       0       
    82 C       2       7.49746 10      10      0       0       0       -0.00284168     0       0       1       3       0       0       
    83 C       3       9.09627 10      10      0       0       0       0.00246597      0       0       2       4       0       0       
    84 C       4       10.6972 10      10      0       0       0       -0.00120123     0       0       3       5       0       0       
    85 C       5       12.2974 10      10      0       0       0       -4.33681e-20    0       0       4       0       0       0       
     81C       1       5.98595 10      10      0       0       0       0.000137586     0       0       2       0       0       0       
     82C       2       7.58621 10      10      0       0       0       -1.58753e-05    0       0       1       3       0       0       
     83C       3       9.18644 10      10      0       0       0       -0.000407466    0       0       2       4       0       0       
     84C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000232838     0       0       3       5       0       0       
     85C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    8686# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    87 C       1       5.89484 10      10      0       0       0       0.00153461      0       0       2       0       0       0       
    88 C       2       7.49735 10      10      0       0       0       -0.00216433     0       0       1       3       0       0       
    89 C       3       9.09684 10      10      0       0       0       0.00112186      0       0       2       4       0       0       
    90 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       -0.000386299    0       0       3       5       0       0       
    91 C       5       12.2974 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
     87C       1       5.98595 10      10      0       0       0       0.000137586     0       0       2       0       0       0       
     88C       2       7.58621 10      10      0       0       0       -5.82095e-05    0       0       1       3       0       0       
     89C       3       9.18636 10      10      0       0       0       -0.000322798    0       0       2       4       0       0       
     90C       4       10.7859 10      10      0       0       0       0.000190504     0       0       3       5       0       0       
     91C       5       12.3858 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       4       0       0       0       
    9292# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    93 C       1       5.89634 10      10      0       0       0       0.00132823      0       0       2       0       0       0       
    94 C       2       7.49721 10      10      0       0       0       -0.00159812     0       0       1       3       0       0       
    95 C       3       9.09695 10      10      0       0       0       0.000407466     0       0       2       4       0       0       
    96 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       3       5       0       0       
    97 C       5       12.2974 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    98 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    99 C       1       5.89699 10      10      0       0       0       0.000460384     0       0       2       0       0       0       
    100 C       2       7.49715 10      10      0       0       0       -0.00059797     0       0       1       3       0       0       
    101 C       3       9.09698 10      10      0       0       0       0.000216963     0       0       2       4       0       0       
    102 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       7.93766e-05     0       0       3       5       0       0       
    103 C       5       12.2973 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    104 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    105 C       1       5.89703 10      10      0       0       0       8.46684e-05     0       0       2       0       0       0       
    106 C       2       7.49714 10      10      0       0       0       -0.000174628    0       0       1       3       0       0       
    107 C       3       9.09699 10      10      0       0       0       0.000153461     0       0       2       4       0       0       
    108 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       4.23342e-05     0       0       3       5       0       0       
    109 C       5       12.2973 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
    110 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    111 C       1       5.89704 10      10      0       0       0       5.82095e-05     0       0       2       0       0       0       
    112 C       2       7.49714 10      10      0       0       0       -0.000137586    0       0       1       3       0       0       
    113 C       3       9.09702 10      10      0       0       0       0.000137586     0       0       2       4       0       0       
    114 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       4.7626e-05      0       0       3       5       0       0       
    115 C       5       12.2973 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
    116 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    117 C       1       5.89705 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       2       0       0       0       
    118 C       2       7.49714 10      10      0       0       0       -0.000116419    0       0       1       3       0       0       
    119 C       3       9.09708 10      10      0       0       0       0.000105835     0       0       2       4       0       0       
    120 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       6.35013e-05     0       0       3       5       0       0       
    121 C       5       12.2973 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
    122 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    123 C       1       5.8971  10      10      0       0       0       4.7626e-05      0       0       2       0       0       0       
    124 C       2       7.49713 10      10      0       0       0       -7.93766e-05    0       0       1       3       0       0       
    125 C       3       9.09711 10      10      0       0       0       4.23342e-05     0       0       2       4       0       0       
    126 C       4       10.6971 10      10      0       0       0       9.52519e-05     0       0       3       5       0       0       
    127 C       5       12.2973 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
     93C       1       5.98595 10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
     94C       2       7.58621 10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
     95C       3       9.18607 10      10      0       0       0       0       0       0       2       4       0       0       
     96C       4       10.786  10      10      0       0       0       0       0       0       3       5       0       0       
     97C       5       12.3858 10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.