Changeset ccb487 for tests


Ignore:
Timestamp:
Apr 3, 2012, 7:58:43 AM (13 years ago)
Author:
Frederik Heber <heber@…>
Branches:
Action_Thermostats, Add_AtomRandomPerturbation, Add_FitFragmentPartialChargesAction, Add_RotateAroundBondAction, Add_SelectAtomByNameAction, Added_ParseSaveFragmentResults, AddingActions_SaveParseParticleParameters, Adding_Graph_to_ChangeBondActions, Adding_MD_integration_tests, Adding_ParticleName_to_Atom, Adding_StructOpt_integration_tests, AtomFragments, Automaking_mpqc_open, AutomationFragmentation_failures, Candidate_v1.5.4, Candidate_v1.6.0, Candidate_v1.6.1, ChangeBugEmailaddress, ChangingTestPorts, ChemicalSpaceEvaluator, CombiningParticlePotentialParsing, Combining_Subpackages, Debian_Package_split, Debian_package_split_molecuildergui_only, Disabling_MemDebug, Docu_Python_wait, EmpiricalPotential_contain_HomologyGraph, EmpiricalPotential_contain_HomologyGraph_documentation, Enable_parallel_make_install, Enhance_userguide, Enhanced_StructuralOptimization, Enhanced_StructuralOptimization_continued, Example_ManyWaysToTranslateAtom, Exclude_Hydrogens_annealWithBondGraph, FitPartialCharges_GlobalError, Fix_BoundInBox_CenterInBox_MoleculeActions, Fix_ChargeSampling_PBC, Fix_ChronosMutex, Fix_FitPartialCharges, Fix_FitPotential_needs_atomicnumbers, Fix_ForceAnnealing, Fix_IndependentFragmentGrids, Fix_ParseParticles, Fix_ParseParticles_split_forward_backward_Actions, Fix_PopActions, Fix_QtFragmentList_sorted_selection, Fix_Restrictedkeyset_FragmentMolecule, Fix_StatusMsg, Fix_StepWorldTime_single_argument, Fix_Verbose_Codepatterns, Fix_fitting_potentials, Fixes, ForceAnnealing_goodresults, ForceAnnealing_oldresults, ForceAnnealing_tocheck, ForceAnnealing_with_BondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph_continued, ForceAnnealing_with_BondGraph_continued_betteresults, ForceAnnealing_with_BondGraph_contraction-expansion, FragmentAction_writes_AtomFragments, FragmentMolecule_checks_bonddegrees, GeometryObjects, Gui_Fixes, Gui_displays_atomic_force_velocity, ImplicitCharges, IndependentFragmentGrids, IndependentFragmentGrids_IndividualZeroInstances, IndependentFragmentGrids_IntegrationTest, IndependentFragmentGrids_Sole_NN_Calculation, JobMarket_RobustOnKillsSegFaults, JobMarket_StableWorkerPool, JobMarket_unresolvable_hostname_fix, MoreRobust_FragmentAutomation, ODR_violation_mpqc_open, PartialCharges_OrthogonalSummation, PdbParser_setsAtomName, PythonUI_with_named_parameters, QtGui_reactivate_TimeChanged_changes, Recreated_GuiChecks, Rewrite_FitPartialCharges, RotateToPrincipalAxisSystem_UndoRedo, SaturateAtoms_findBestMatching, SaturateAtoms_singleDegree, StoppableMakroAction, Subpackage_CodePatterns, Subpackage_JobMarket, Subpackage_LinearAlgebra, Subpackage_levmar, Subpackage_mpqc_open, Subpackage_vmg, Switchable_LogView, ThirdParty_MPQC_rebuilt_buildsystem, TrajectoryDependenant_MaxOrder, TremoloParser_IncreasedPrecision, TremoloParser_MultipleTimesteps, TremoloParser_setsAtomName, Ubuntu_1604_changes, stable
Children:
08a0f52
Parents:
a275b3
git-author:
Frederik Heber <heber@…> (03/15/12 17:29:54)
git-committer:
Frederik Heber <heber@…> (04/03/12 07:58:43)
Message:

TremoloParser now always writes current domain as "# Box ..." into file.

Location:
tests/regression
Files:
12 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • tests/regression/Domain/RepeatBox/post/ec.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      type    x=3     u=3     neighbors=4
     2# Box   40      0       0       0       40      0       0       0       40
    231       O       7.36404 5       5.01    0       0       0       4       0       0       0       
    342       OS      5.50419 6.07129 5       0       0       0       4       5       0       0       

  • tests/regression/Domain/RepeatBox/pre/ec.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      type    x=3     u=3     neighbors=4
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       O       7.36404 5       5.01    0       0       0       4       0       0       0       
    342       OS      5.50419 6.07129 5       0       0       0       4       5       0       0       

  • tests/regression/Filling/FillVoidWithMolecule/post/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   30      0       0       0       30      0       0       0       30
    231       NA      SLES    1       17.397  20.231  11.737  Na      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       16.282  18.88   14.208  S       3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Filling/FillVoidWithMolecule/pre/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   30      0       0       0       30      0       0       0       30
    231       NA      SLES    1       17.397  20.231  11.737  Na      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       16.282  18.88   14.208  S       3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Filling/FillVoidWithMolecule/testsuite-fill-void-with-tenside-molecule.at

    ra275b3 rccb487  
    1515
    1616AT_SETUP([Filling - filling void space besides tenside micelle in box with Undo])
    17 AT_XFAIL_IF([/bin/true])
    1817AT_KEYWORDS([filling fill-void undo])
    1918
    … …  
    2322AT_CHECK([chmod u+w $file], 0)
    2423AT_CHECK([../../molecuilder -i $file -B "30,0,30,0,0,30" --fill-void water.data --distances "3.1, 3.1, 3.1" --distance-to-molecule "2.1" --DoRotate 0 --undo], 0, [stdout], [stderr])
    25 AT_CHECK([diff $file ${abs_top_srcdir}/tests/regression/Filling/FillVoidWithMolecule/post/tensid.data], 0, [ignore], [ignore])
     24AT_CHECK([diff $file ${abs_top_srcdir}/tests/regression/Filling/FillVoidWithMolecule/pre/tensid.data], 0, [ignore], [ignore])
    2625
    2726AT_CLEANUP

  • tests/regression/Makefile.am

    ra275b3 rccb487  
    6161        $(srcdir)/Filling/SuspendInWater/testsuite-suspend-in-water.at \
    6262        $(srcdir)/Filling/FillVoidWithMolecule/testsuite-fill-void-with-molecule.at \
     63        $(srcdir)/Filling/FillVoidWithMolecule/testsuite-fill-void-with-tenside-molecule.at \
    6364        $(srcdir)/Fragmentation/testsuite-fragmentation.at \
    6465        $(srcdir)/Fragmentation/FragmentMolecule/testsuite-fragmentation-fragment-molecule.at \

  • tests/regression/Molecules/Copy/post/tensid-undo.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       NA      SLES    1       32.397  35.231  26.737  NA      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       31.282  33.88   29.208  SL      3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Molecules/Copy/post/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       NA      SLES    1       32.397  35.231  26.737  NA      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       31.282  33.88   29.208  SL      3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Molecules/Copy/pre/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       NA      SLES    1       32.397  35.231  26.737  NA      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       31.282  33.88   29.208  SL      3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Molecules/CreateMicelle/post/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       NA      SLES    1       -4.78921        -8.81932        -49.4988        NA      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       -3.65465        -6.08892        -48.8416        SL      3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Molecules/CreateMicelle/pre/tensid.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      Id      name    resName chainID x=3     type    neighbors=4     charge
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    231       NA      SLES    1       32.397  35.231  26.737  NA      0       0       0       0       1.000000e+00   
    342       S       SLES    1       31.282  33.88   29.208  SL      3       4       5       6       1.330000e+00   

  • tests/regression/Parser/Tremolo-SetAtomdata/post/argon.data

    ra275b3 rccb487  
    11# ATOMDATA      type    x=3
     2# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    23Ar      4.72977 8       8       
    34Ar      7.3     8       8       
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.