Changeset 441d40


Ignore:
Timestamp:
Apr 10, 2018, 6:43:31 AM (7 years ago)
Author:
Frederik Heber <frederik.heber@…>
Branches:
AutomationFragmentation_failures, Candidate_v1.6.1, ChemicalSpaceEvaluator, Exclude_Hydrogens_annealWithBondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph_contraction-expansion, Gui_displays_atomic_force_velocity, PythonUI_with_named_parameters, StoppableMakroAction, TremoloParser_IncreasedPrecision
Children:
0c4f24
Parents:
90050b
git-author:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (08/02/17 20:28:27)
git-committer:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (04/10/18 06:43:31)
Message:

TESTFIX: bondgraph annealing is working better than expected.

Location:
tests/Python/ForceAnnealing
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • tests/Python/ForceAnnealing/post/five_carbon_test_bondgraph.data

    r90050b r441d40  
    1313C       5       12.4    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
    1414# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    15 C       1       5.99762 10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
    16 C       2       7.55664 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
    17 C       3       8.79358 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
    18 C       4       10.7566 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
    19 C       5       12.3976 10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
     15C       1       5.97149 10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
     16C       2       7.49973 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
     17C       3       8.95748 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
     18C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
     19C       5       12.3715 10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
    2020# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    21 C       1       6.00099 10      10      0       0       0       -0.0216857      0       0       2       0       0       0       
    22 C       2       7.54962 10      10      0       0       0       -0.170437       0       0       1       3       0       0       
    23 C       3       8.88895 10      10      0       0       0       0.384225        0       0       2       4       0       0       
    24 C       4       10.7496 10      10      0       0       0       -0.170406       0       0       3       5       0       0       
    25 C       5       12.401  10      10      0       0       0       -0.0216963      0       0       4       0       0       0       
     21C       1       5.93924 10      10      0       0       0       -0.0379738      0       0       2       0       0       0       
     22C       2       7.49102 10      10      0       0       0       -0.0373017      0       0       1       3       0       0       
     23C       3       9.03941 10      10      0       0       0       0.150588        0       0       2       4       0       0       
     24C       4       10.6911 10      10      0       0       0       -0.0373705      0       0       3       5       0       0       
     25C       5       12.3392 10      10      0       0       0       -0.037942       0       0       4       0       0       0       
    2626# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    27 C       1       6.01638 10      10      0       0       0       -0.0271838      0       0       2       0       0       0       
    28 C       2       7.58211 10      10      0       0       0       -0.110757       0       0       1       3       0       0       
    29 C       3       9.04595 10      10      0       0       0       0.275871        0       0       2       4       0       0       
    30 C       4       10.7821 10      10      0       0       0       -0.11073        0       0       3       5       0       0       
    31 C       5       12.4164 10      10      0       0       0       -0.0271997      0       0       4       0       0       0       
     27C       1       5.90802 10      10      0       0       0       -0.0255169      0       0       2       0       0       0       
     28C       2       7.49975 10      10      0       0       0       -0.00179391     0       0       1       3       0       0       
     29C       3       9.08428 10      10      0       0       0       0.054664        0       0       2       4       0       0       
     30C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.00189975     0       0       3       5       0       0       
     31C       5       12.3082 10      10      0       0       0       -0.0254534      0       0       4       0       0       0       
    3232# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    33 C       1       5.98362 10      10      0       0       0       -0.0181349      0       0       2       0       0       0       
    34 C       2       7.58977 10      10      0       0       0       -0.0539179      0       0       1       3       0       0       
    35 C       3       9.13561 10      10      0       0       0       0.1441  0       0       2       4       0       0       
    36 C       4       10.7898 10      10      0       0       0       -0.0538967      0       0       3       5       0       0       
    37 C       5       12.3835 10      10      0       0       0       -0.0181508      0       0       4       0       0       0       
     33C       1       5.90803 10      10      0       0       0       -0.0043763      0       0       2       0       0       0       
     34C       2       7.49176 10      10      0       0       0       -0.00381008     0       0       1       3       0       0       
     35C       3       9.10147 10      10      0       0       0       0.0163992       0       0       2       4       0       0       
     36C       4       10.6908 10      10      0       0       0       -0.00376774     0       0       3       5       0       0       
     37C       5       12.3079 10      10      0       0       0       -0.00444509     0       0       4       0       0       0       
    3838# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    39 C       1       5.98766 10      10      0       0       0       0.00325444      0       0       2       0       0       0       
    40 C       2       7.59245 10      10      0       0       0       -0.0319147      0       0       1       3       0       0       
    41 C       3       9.15835 10      10      0       0       0       0.0573364       0       0       2       4       0       0       
    42 C       4       10.7925 10      10      0       0       0       -0.0320099      0       0       3       5       0       0       
    43 C       5       12.3876 10      10      0       0       0       0.00333382      0       0       4       0       0       0       
     39C       1       5.90707 10      10      0       0       0       -0.00860971     0       0       2       0       0       0       
     40C       2       7.49521 10      10      0       0       0       0.013748        0       0       1       3       0       0       
     41C       3       9.09579 10      10      0       0       0       -0.0107846      0       0       2       4       0       0       
     42C       4       10.6951 10      10      0       0       0       0.0146953       0       0       3       5       0       0       
     43C       5       12.3069 10      10      0       0       0       -0.00904893     0       0       4       0       0       0       
    4444# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    45 C       1       5.98842 10      10      0       0       0       0.00253476      0       0       2       0       0       0       
    46 C       2       7.59255 10      10      0       0       0       -0.0205797      0       0       1       3       0       0       
    47 C       3       9.16535 10      10      0       0       0       0.0361163       0       0       2       4       0       0       
    48 C       4       10.7926 10      10      0       0       0       -0.0206644      0       0       3       5       0       0       
    49 C       5       12.3884 10      10      0       0       0       0.00259297      0       0       4       0       0       0       
     45C       1       5.90506 10      10      0       0       0       -0.00627604     0       0       2       0       0       0       
     46C       2       7.49716 10      10      0       0       0       0.00658296      0       0       1       3       0       0       
     47C       3       9.09547 10      10      0       0       0       -0.000672055    0       0       2       4       0       0       
     48C       4       10.6973 10      10      0       0       0       0.00660942      0       0       3       5       0       0       
     49C       5       12.305  10      10      0       0       0       -0.00624429     0       0       4       0       0       0       
    5050# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    51 C       1       5.99017 10      10      0       0       0       0.0021855       0       0       2       0       0       0       
    52 C       2       7.59433 10      10      0       0       0       -0.0165791      0       0       1       3       0       0       
    53 C       3       9.17263 10      10      0       0       0       0.0288137       0       0       2       4       0       0       
    54 C       4       10.7943 10      10      0       0       0       -0.0166426      0       0       3       5       0       0       
    55 C       5       12.3901 10      10      0       0       0       0.00222254      0       0       4       0       0       0       
     51C       1       5.90296 10      10      0       0       0       -0.0041805      0       0       2       0       0       0       
     52C       2       7.4988  10      10      0       0       0       0.00328619      0       0       1       3       0       0       
     53C       3       9.09605 10      10      0       0       0       0.0018627       0       0       2       4       0       0       
     54C       4       10.6989 10      10      0       0       0       0.00310627      0       0       3       5       0       0       
     55C       5       12.3033 10      10      0       0       0       -0.00407466     0       0       4       0       0       0       
    5656# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    57 C       1       5.99673 10      10      0       0       0       0.00220138      0       0       2       0       0       0       
    58 C       2       7.59359 10      10      0       0       0       -0.0136845      0       0       1       3       0       0       
    59 C       3       9.1839  10      10      0       0       0       0.0229504       0       0       2       4       0       0       
    60 C       4       10.7936 10      10      0       0       0       -0.0136898      0       0       3       5       0       0       
    61 C       5       12.3961 10      10      0       0       0       0.00222254      0       0       4       0       0       0       
     57C       1       5.90167 10      10      0       0       0       -0.00220138     0       0       2       0       0       0       
     58C       2       7.49933 10      10      0       0       0       0.00074614      0       0       1       3       0       0       
     59C       3       9.0975  10      10      0       0       0       0.00296339      0       0       2       4       0       0       
     60C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000820225     0       0       3       5       0       0       
     61C       5       12.302  10      10      0       0       0       -0.00232838     0       0       4       0       0       0       
    6262# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    63 C       1       5.99607 10      10      0       0       0       -0.00166162     0       0       2       0       0       0       
    64 C       2       7.59504 10      10      0       0       0       -0.00346611     0       0       1       3       0       0       
    65 C       3       9.19027 10      10      0       0       0       0.0102607       0       0       2       4       0       0       
    66 C       4       10.7951 10      10      0       0       0       -0.00381008     0       0       3       5       0       0       
    67 C       5       12.3957 10      10      0       0       0       -0.00132294     0       0       4       0       0       0       
     63C       1       5.90028 10      10      0       0       0       -0.00123827     0       0       2       0       0       0       
     64C       2       7.49949 10      10      0       0       0       0.00026988      0       0       1       3       0       0       
     65C       3       9.10006 10      10      0       0       0       0.00207967      0       0       2       4       0       0       
     66C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000158753     0       0       3       5       0       0       
     67C       5       12.3006 10      10      0       0       0       -0.00127003     0       0       4       0       0       0       
    6868# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    69 C       1       5.99616 10      10      0       0       0       -0.000545053    0       0       2       0       0       0       
    70 C       2       7.59523 10      10      0       0       0       -0.00197912     0       0       1       3       0       0       
    71 C       3       9.192   10      10      0       0       0       0.0050801       0       0       2       4       0       0       
    72 C       4       10.7952 10      10      0       0       0       -0.00223842     0       0       3       5       0       0       
    73 C       5       12.3959 10      10      0       0       0       -0.000317506    0       0       4       0       0       0       
     69C       1       5.90018 10      10      0       0       0       -0.00041805     0       0       2       0       0       0       
     70C       2       7.49988 10      10      0       0       0       0.000719681     0       0       1       3       0       0       
     71C       3       9.09986 10      10      0       0       0       -0.000545053    0       0       2       4       0       0       
     72C       4       10.6998 10      10      0       0       0       0.000772599     0       0       3       5       0       0       
     73C       5       12.3003 10      10      0       0       0       -0.000529177    0       0       4       0       0       0       
    7474# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    75 C       1       5.99623 10      10      0       0       0       -0.000492135    0       0       2       0       0       0       
    76 C       2       7.59535 10      10      0       0       0       -0.00121711     0       0       1       3       0       0       
    77 C       3       9.19284 10      10      0       0       0       0.00340261      0       0       2       4       0       0       
    78 C       4       10.7954 10      10      0       0       0       -0.00132294     0       0       3       5       0       0       
    79 C       5       12.3959 10      10      0       0       0       -0.000370424    0       0       4       0       0       0       
     75C       1       5.90014 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       2       0       0       0       
     76C       2       7.49996 10      10      0       0       0       0.00014817      0       0       1       3       0       0       
     77C       3       9.09987 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       4       0       0       
     78C       4       10.6999 10      10      0       0       0       0.000296339     0       0       3       5       0       0       
     79C       5       12.3002 10      10      0       0       0       -0.000264589    0       0       4       0       0       0       
    8080# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    81 C       1       5.99613 10      10      0       0       0       -0.000465676    0       0       2       0       0       0       
    82 C       2       7.59549 10      10      0       0       0       -0.000862559    0       0       1       3       0       0       
    83 C       3       9.19376 10      10      0       0       0       0.00268293      0       0       2       4       0       0       
    84 C       4       10.7955 10      10      0       0       0       -0.00109011     0       0       3       5       0       0       
    85 C       5       12.3959 10      10      0       0       0       -0.000264589    0       0       4       0       0       0       
     81C       1       5.90011 10      10      0       0       0       -9.52519e-05    0       0       2       0       0       0       
     82C       2       7.5     10      10      0       0       0       4.7626e-05      0       0       1       3       0       0       
     83C       3       9.09989 10      10      0       0       0       6.35013e-05     0       0       2       4       0       0       
     84C       4       10.7    10      10      0       0       0       0.000142878     0       0       3       5       0       0       
     85C       5       12.3001 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    8686# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    87 C       1       5.99613 10      10      0       0       0       -0.000338673    0       0       2       0       0       0       
    88 C       2       7.59563 10      10      0       0       0       -0.000576803    0       0       1       3       0       0       
    89 C       3       9.19481 10      10      0       0       0       0.00183625      0       0       2       4       0       0       
    90 C       4       10.7956 10      10      0       0       0       -0.000709098    0       0       3       5       0       0       
    91 C       5       12.3959 10      10      0       0       0       -0.000211671    0       0       4       0       0       0       
     87C       1       5.90008 10      10      0       0       0       -5.82095e-05    0       0       2       0       0       0       
     88C       2       7.5     10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
     89C       3       9.09993 10      10      0       0       0       0.000116419     0       0       2       4       0       0       
     90C       4       10.7    10      10      0       0       0       -5.29177e-06    0       0       3       5       0       0       
     91C       5       12.3    10      10      0       0       0       -5.29177e-05    0       0       4       0       0       0       
    9292# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    93 C       1       5.99618 10      10      0       0       0       -0.000264589    0       0       2       0       0       0       
    94 C       2       7.59572 10      10      0       0       0       -0.000169337    0       0       1       3       0       0       
    95 C       3       9.1953  10      10      0       0       0       0.000851975     0       0       2       4       0       0       
    96 C       4       10.7957 10      10      0       0       0       -0.000259297    0       0       3       5       0       0       
    97 C       5       12.3959 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    98 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    99 C       1       5.99613 10      10      0       0       0       -0.000243422    0       0       2       0       0       0       
    100 C       2       7.59576 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       1       3       0       0       
    101 C       3       9.19545 10      10      0       0       0       0.000433925     0       0       2       4       0       0       
    102 C       4       10.7957 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       3       5       0       0       
    103 C       5       12.396  10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
    104 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    105 C       1       5.99607 10      10      0       0       0       -0.000195796    0       0       2       0       0       0       
    106 C       2       7.59579 10      10      0       0       0       3.17506e-05     0       0       1       3       0       0       
    107 C       3       9.19554 10      10      0       0       0       0.000296339     0       0       2       4       0       0       
    108 C       4       10.7957 10      10      0       0       0       2.64589e-05     0       0       3       5       0       0       
    109 C       5       12.396  10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    110 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    111 C       1       5.99606 10      10      0       0       0       -0.00014817     0       0       2       0       0       0       
    112 C       2       7.59591 10      10      0       0       0       1.58753e-05     0       0       1       3       0       0       
    113 C       3       9.19566 10      10      0       0       0       0.000216963     0       0       2       4       0       0       
    114 C       4       10.7958 10      10      0       0       0       7.40848e-05     0       0       3       5       0       0       
    115 C       5       12.396  10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    116 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    117 C       1       5.99609 10      10      0       0       0       -7.93766e-05    0       0       2       0       0       0       
    118 C       2       7.59594 10      10      0       0       0       -5.29177e-05    0       0       1       3       0       0       
    119 C       3       9.19599 10      10      0       0       0       0.000206379     0       0       2       4       0       0       
    120 C       4       10.7961 10      10      0       0       0       3.17506e-05     0       0       3       5       0       0       
    121 C       5       12.3961 10      10      0       0       0       -0.000105835    0       0       4       0       0       0       
    122 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    123 C       1       5.99608 10      10      0       0       0       -7.93766e-05    0       0       2       0       0       0       
    124 C       2       7.59598 10      10      0       0       0       0.000105835     0       0       1       3       0       0       
    125 C       3       9.19602 10      10      0       0       0       3.17506e-05     0       0       2       4       0       0       
    126 C       4       10.796  10      10      0       0       0       -5.82095e-05    0       0       3       5       0       0       
    127 C       5       12.396  10      10      0       0       0       -2.71051e-21    0       0       4       0       0       0       
     93C       1       5.90004 10      10      0       0       0       -4.23342e-05    0       0       2       0       0       0       
     94C       2       7.50001 10      10      0       0       0       5.29177e-06     0       0       1       3       0       0       
     95C       3       9.09999 10      10      0       0       0       7.40848e-05     0       0       2       4       0       0       
     96C       4       10.6999 10      10      0       0       0       -3.70424e-05    0       0       3       5       0       0       
     97C       5       12.3    10      10      0       0       0       1.35525e-21     0       0       4       0       0       0       
  • tests/Python/ForceAnnealing/post/two_carbon_test_bondgraph.data

    r90050b r441d40  
    77C       2       8.72646 10      10      0       0       0       0.264589        0       0       1       0       0       0       
    88# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    9 C       1       7.54708 10      10      0       0       0       -0.236585       0       0       2       0       0       0       
    10 C       2       8.75292 10      10      0       0       0       0.236585        0       0       1       0       0       0       
     9C       1       7.35001 10      10      0       0       0       -0.236585       0       0       2       0       0       0       
     10C       2       8.94999 10      10      0       0       0       0.236585        0       0       1       0       0       0       
    1111# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    12 C       1       7.44855 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       2       0       0       0       
    13 C       2       8.85145 10      10      0       0       0       0.208581        0       0       1       0       0       0       
    14 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    15 C       1       7.37085 10      10      0       0       0       -0.104301       0       0       2       0       0       0       
    16 C       2       8.92915 10      10      0       0       0       0.104301        0       0       1       0       0       0       
    17 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    18 C       1       7.36166 10      10      0       0       0       -0.0220667      0       0       2       0       0       0       
    19 C       2       8.93834 10      10      0       0       0       0.0220667       0       0       1       0       0       0       
    20 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    21 C       1       7.36043 10      10      0       0       0       -0.0123404      0       0       2       0       0       0       
    22 C       2       8.93957 10      10      0       0       0       0.0123404       0       0       1       0       0       0       
    23 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    24 C       1       7.35919 10      10      0       0       0       -0.0110386      0       0       2       0       0       0       
    25 C       2       8.94081 10      10      0       0       0       0.0110386       0       0       1       0       0       0       
    26 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    27 C       1       7.3546  10      10      0       0       0       -0.00972628     0       0       2       0       0       0       
    28 C       2       8.9454  10      10      0       0       0       0.00972628      0       0       1       0       0       0       
    29 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    30 C       1       7.35098 10      10      0       0       0       -0.00486843     0       0       2       0       0       0       
    31 C       2       8.94902 10      10      0       0       0       0.00486843      0       0       1       0       0       0       
    32 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    33 C       1       7.35054 10      10      0       0       0       -0.00103719     0       0       2       0       0       0       
    34 C       2       8.94946 10      10      0       0       0       0.00103719      0       0       1       0       0       0       
    35 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    36 C       1       7.35049 10      10      0       0       0       -0.000571511    0       0       2       0       0       0       
    37 C       2       8.94951 10      10      0       0       0       0.000571511     0       0       1       0       0       0       
    38 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    39 C       1       7.35043 10      10      0       0       0       -0.000518594    0       0       2       0       0       0       
    40 C       2       8.94957 10      10      0       0       0       0.000518594     0       0       1       0       0       0       
    41 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    42 C       1       7.3502  10      10      0       0       0       -0.000455092    0       0       2       0       0       0       
    43 C       2       8.9498  10      10      0       0       0       0.000455092     0       0       1       0       0       0       
    44 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    45 C       1       7.35005 10      10      0       0       0       -0.000211671    0       0       2       0       0       0       
    46 C       2       8.94995 10      10      0       0       0       0.000211671     0       0       1       0       0       0       
    47 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    48 C       1       7.35003 10      10      0       0       0       -5.29177e-05    0       0       2       0       0       0       
    49 C       2       8.94997 10      10      0       0       0       5.29177e-05     0       0       1       0       0       0       
    50 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    51 C       1       7.35002 10      10      0       0       0       -3.17506e-05    0       0       2       0       0       0       
    52 C       2       8.94998 10      10      0       0       0       3.17506e-05     0       0       1       0       0       0       
    53 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    54 C       1       7.35002 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       0       0       0       
    55 C       2       8.94998 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       1       0       0       0       
    56 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    57 C       1       7.35002 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       0       0       0       
    58 C       2       8.94998 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       1       0       0       0       
    59 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    60 C       1       7.35002 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       0       0       0       
    61 C       2       8.94998 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       1       0       0       0       
    62 # ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    63 C       1       7.35002 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       0       0       0       
    64 C       2       8.94998 10      10      0       0       0       2.11671e-05     0       0       1       0       0       0       
     12C       1       7.35    10      10      0       0       0       -1.05835e-05    0       0       2       0       0       0       
     13C       2       8.95    10      10      0       0       0       1.05835e-05     0       0       1       0       0       0       
  • tests/Python/ForceAnnealing/testsuite-python-forceannealing-ising.at

    r90050b r441d40  
    5151
    5252file=two_carbon_test.data
    53 AT_CHECK([../../run ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/pre/ising_model_chain.py ./$file ./ 30 2 "1"], 0, [stdout], [ignore])
     53AT_CHECK([../../run ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/pre/ising_model_chain.py ./$file ./ 3 2 "1"], 0, [stdout], [ignore])
    5454AT_CHECK([grep "Largest remaining force components.*e-05" stdout], 0, [ignore], [ignore])
    5555AT_CHECK([diff $file ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/post/two_carbon_test_bondgraph.data], 0, [ignore], [ignore])
     
    6565
    6666file=five_carbon_test.data
    67 AT_CHECK([../../run ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/pre/ising_model_chain.py ./$file ./ 20 5 "1"], 0, [stdout], [ignore])
    68 AT_CHECK([grep "Largest remaining force components.*0.0001" stdout], 0, [ignore], [ignore])
     67AT_CHECK([../../run ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/pre/ising_model_chain.py ./$file ./ 15 5 "1"], 0, [stdout], [ignore])
     68AT_CHECK([grep "Largest remaining force components.*e-05" stdout], 0, [ignore], [ignore])
    6969AT_CHECK([diff $file ${abs_top_srcdir}/tests/Python/ForceAnnealing/post/five_carbon_test_bondgraph.data], 0, [ignore], [ignore])
    7070
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.