source: tests/integration/MolecularDynamics/post/water-system_initial_steps.data@ 1ca493a

Candidate_v1.7.0 stable
Last change on this file since 1ca493a was 4fc0ea, checked in by Frederik Heber <frederik.heber@…>, 8 years ago

TESTFIX: Changes to various regression and Python tests because of modified output precision.

  • basically needed to change all .data files diff'ed against in tests.
  • TESTS: Removed XFAIL from all tests marked earlier as such.
  • TESTS: for the MolecularDynamics integration tests the ekin files have slightly changed but only in the last digits (typical relative error of 1e-5 at most).
  • Property mode set to 100644
File size: 14.6 KB
RevLine 
[37fe17]1# ATOMDATA Id type x=3 u=3 F=3 neighbors=2
2# Box 10 0 0 0 10 0 0 0 10
[4fc0ea]31 O 2.386666667 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 2 3
42 H 3.106666667 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 1 0
53 H 1.666666667 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 1 0
64 O 2.386666667 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 5 6
75 H 3.106666667 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 4 0
86 H 1.666666667 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 4 0
97 O 2.386666667 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 8 9
108 H 3.106666667 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 7 0
119 H 1.666666667 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 7 0
1210 O 2.386666667 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 11 12
1311 H 3.106666667 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 10 0
1412 H 1.666666667 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 10 0
1513 O 2.386666667 5 5 0 0 0 0 0 0 14 15
1614 H 3.106666667 5 5.558 0 0 0 0 0 0 13 0
1715 H 1.666666667 5 5.558 0 0 0 0 0 0 13 0
1816 O 2.386666667 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 17 18
1917 H 3.106666667 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 16 0
2018 H 1.666666667 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 16 0
2119 O 2.386666667 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 20 21
2220 H 3.106666667 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 19 0
2321 H 1.666666667 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 19 0
2422 O 2.386666667 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 23 24
2523 H 3.106666667 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 22 0
2624 H 1.666666667 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 22 0
2725 O 2.386666667 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 26 27
2826 H 3.106666667 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 25 0
2927 H 1.666666667 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 25 0
3028 O 5.72 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 29 30
3129 H 6.44 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 28 0
3230 H 5 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 28 0
3331 O 5.72 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 32 33
3432 H 6.44 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 31 0
3533 H 5 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 31 0
3634 O 5.72 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 35 36
3735 H 6.44 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 34 0
3836 H 5 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 34 0
3937 O 5.72 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 38 39
4038 H 6.44 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 37 0
4139 H 5 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 37 0
[37fe17]4240 O 5.72 5 5 0 0 0 0 0 0 41 42
4341 H 6.44 5 5.558 0 0 0 0 0 0 40 0
4442 H 5 5 5.558 0 0 0 0 0 0 40 0
[4fc0ea]4543 O 5.72 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 44 45
4644 H 6.44 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 43 0
4745 H 5 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 43 0
4846 O 5.72 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 47 48
4947 H 6.44 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 46 0
5048 H 5 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 46 0
5149 O 5.72 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 50 51
5250 H 6.44 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 49 0
5351 H 5 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 49 0
5452 O 5.72 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 53 54
5553 H 6.44 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 52 0
5654 H 5 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 52 0
5755 O 9.053333333 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 56 57
5856 H 9.773333333 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 55 0
5957 H 8.333333333 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 55 0
6058 O 9.053333333 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 59 60
6159 H 9.773333333 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 58 0
6260 H 8.333333333 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 58 0
6361 O 9.053333333 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 62 63
6462 H 9.773333333 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 61 0
6563 H 8.333333333 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 61 0
6664 O 9.053333333 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 65 66
6765 H 9.773333333 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 64 0
6866 H 8.333333333 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 64 0
6967 O 9.053333333 5 5 0 0 0 0 0 0 68 69
7068 H 9.773333333 5 5.558 0 0 0 0 0 0 67 0
7169 H 8.333333333 5 5.558 0 0 0 0 0 0 67 0
7270 O 9.053333333 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 71 72
7371 H 9.773333333 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 70 0
7472 H 8.333333333 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 70 0
7573 O 9.053333333 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 74 75
7674 H 9.773333333 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 73 0
7775 H 8.333333333 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 73 0
7876 O 9.053333333 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 77 78
7977 H 9.773333333 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 76 0
8078 H 8.333333333 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 76 0
8179 O 9.053333333 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 80 81
8280 H 9.773333333 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 79 0
8381 H 8.333333333 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 79 0
[37fe17]84# ATOMDATA Id type x=3 u=3 F=3 neighbors=2
[4fc0ea]851 O 2.386666667 1.666666667 1.666666667 -1.997246889e-16 -3.55691333e-16 -0.0005547061447 -1.278523298e-14 -2.276282255e-14 -0.03549897444 2 3
862 H 3.106666667 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.856377236e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.554891301e-14 0.01774948722 1 0
873 H 1.666666667 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.849817132e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.552246268e-14 0.01774948722 1 0
884 O 2.386666667 1.666666667 5 -2.243735318e-16 -3.571404991e-16 -0.0005547061447 -1.436266032e-14 -2.285556338e-14 -0.03549897444 5 6
895 H 3.106666667 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.839203029e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.547966661e-14 0.01774948722 4 0
906 H 1.666666667 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.84399014e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.549896824e-14 0.01774948722 4 0
917 O 2.386666667 1.666666667 8.333333333 -2.248128252e-16 -3.569472075e-16 -0.0005547061447 -1.439077334e-14 -2.284319349e-14 -0.03549897444 8 9
928 H 3.106666667 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.841942343e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.549071153e-14 0.01774948722 7 0
939 H 1.666666667 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.844318756e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.550029322e-14 0.01774948722 7 0
9410 O 2.386666667 5 1.666666667 -1.963268889e-16 5.524596033e-16 -0.0005547061447 -1.256778736e-14 3.535520477e-14 -0.03549897444 11 12
9511 H 3.106666667 5 2.224666667 0.008368844759 -3.338624811e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346133524e-14 0.01774948722 10 0
9612 H 1.666666667 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.330183169e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.342729854e-14 0.01774948722 10 0
9713 O 2.386666667 5 5 -1.984605997e-16 5.508339935e-16 -0.0005547061447 -1.270433632e-14 3.525117225e-14 -0.03549897444 14 15
9814 H 3.106666667 5 5.558 0.008368844759 -3.321851548e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.339370544e-14 0.01774948722 13 0
9915 H 1.666666667 5 5.558 -0.008368844759 -3.321154714e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.339089581e-14 0.01774948722 13 0
10016 O 2.386666667 5 8.333333333 -2.321857823e-16 5.523175311e-16 -0.0005547061447 -1.486261311e-14 3.534611272e-14 -0.03549897444 17 18
10117 H 3.106666667 5 8.891333333 0.008368844759 -3.339643059e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346544081e-14 0.01774948722 16 0
10218 H 1.666666667 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.326909947e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.341410091e-14 0.01774948722 16 0
10319 O 2.386666667 8.333333333 1.666666667 -2.362927274e-16 1.129552405e-15 -0.0005547061447 -1.512544117e-14 7.228683569e-14 -0.03549897444 20 21
10420 H 3.106666667 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.332391643e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343620311e-14 0.01774948722 19 0
10521 H 1.666666667 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.34399934e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348300534e-14 0.01774948722 19 0
10622 O 2.386666667 8.333333333 5 -2.056650116e-16 1.12955606e-15 -0.0005547061447 -1.316538987e-14 7.228706962e-14 -0.03549897444 23 24
10723 H 3.106666667 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.331764859e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343367591e-14 0.01774948722 22 0
10824 H 1.666666667 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.344684143e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348576646e-14 0.01774948722 22 0
10925 O 2.386666667 8.333333333 8.333333333 -1.947463291e-16 1.13196827e-15 -0.0005547061447 -1.246663786e-14 7.244144141e-14 -0.03549897444 26 27
11026 H 3.106666667 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.358607042e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.354190359e-14 0.01774948722 25 0
11127 H 1.666666667 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.356128615e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.353191057e-14 0.01774948722 25 0
11228 O 5.72 1.666666667 1.666666667 3.873237139e-16 -3.56852997e-16 -0.0005547061447 2.478351661e-14 -2.28371644e-14 -0.03549897444 29 30
11329 H 6.44 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.849322481e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.552046824e-14 0.01774948722 28 0
11430 H 5 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.83843393e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54765656e-14 0.01774948722 28 0
11531 O 5.72 1.666666667 5 3.68679743e-16 -3.578589999e-16 -0.0005547061447 2.359037705e-14 -2.290154456e-14 -0.03549897444 32 33
11632 H 6.44 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.83265041e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.545324645e-14 0.01774948722 31 0
11733 H 5 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.839138698e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.547940723e-14 0.01774948722 31 0
11834 O 5.72 1.666666667 8.333333333 4.011327678e-16 -3.566660461e-16 -0.0005547061447 2.566724082e-14 -2.282520029e-14 -0.03549897444 35 36
11935 H 6.44 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.837603809e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.547321856e-14 0.01774948722 34 0
12036 H 5 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.853119891e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.55357794e-14 0.01774948722 34 0
12137 O 5.72 5 1.666666667 4.223622942e-16 5.510170153e-16 -0.0005547061447 2.702584559e-14 3.526288491e-14 -0.03549897444 38 39
12238 H 6.44 5 2.224666667 0.008368844759 -3.321078845e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.33905899e-14 0.01774948722 37 0
12339 H 5 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.324832343e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.340572401e-14 0.01774948722 37 0
12440 O 5.72 5 5 4.107093641e-16 5.528919359e-16 -0.0005547061447 2.628010468e-14 3.538287233e-14 -0.03549897444 41 42
12541 H 6.44 5 5.558 0.008368844759 -3.34003147e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346700689e-14 0.01774948722 40 0
12642 H 5 5 5.558 -0.008368844759 -3.335638502e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.344929444e-14 0.01774948722 40 0
12743 O 5.72 5 8.333333333 4.322374307e-16 5.530601452e-16 -0.0005547061447 2.765781483e-14 3.539363705e-14 -0.03549897444 44 45
12844 H 6.44 5 8.891333333 0.008368844759 -3.344148577e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.348360706e-14 0.01774948722 43 0
12945 H 5 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.334191218e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.344345899e-14 0.01774948722 43 0
13046 O 5.72 8.333333333 1.666666667 3.527002211e-16 1.131079331e-15 -0.0005547061447 2.256775157e-14 7.238455283e-14 -0.03549897444 47 48
13147 H 6.44 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.352374875e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.351677549e-14 0.01774948722 46 0
13248 H 5 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.348251512e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.35001501e-14 0.01774948722 46 0
13349 O 5.72 8.333333333 5 4.024389933e-16 1.130557614e-15 -0.0005547061447 2.575083403e-14 7.235116507e-14 -0.03549897444 50 51
13450 H 6.44 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.342853722e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.347838621e-14 0.01774948722 49 0
13551 H 5 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.349491971e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.350515163e-14 0.01774948722 49 0
13652 O 5.72 8.333333333 8.333333333 4.044722942e-16 1.130969176e-15 -0.0005547061447 2.588095716e-14 7.237750339e-14 -0.03549897444 53 54
13753 H 6.44 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.344749329e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.348602929e-14 0.01774948722 52 0
13854 H 5 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.354128683e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.352384685e-14 0.01774948722 52 0
13955 O 9.053333333 1.666666667 1.666666667 -1.62160808e-15 -3.555639294e-16 -0.0005547061447 -1.037800825e-13 -2.275466923e-14 -0.03549897444 56 57
14056 H 9.773333333 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.867525325e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.559386211e-14 0.01774948722 55 0
14157 H 8.333333333 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.840691196e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54856669e-14 0.01774948722 55 0
14258 O 9.053333333 1.666666667 5 -1.646361815e-15 -3.567492875e-16 -0.0005547061447 -1.053642225e-13 -2.28305274e-14 -0.03549897444 59 60
14359 H 9.773333333 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.846472516e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.550897719e-14 0.01774948722 58 0
14460 H 8.333333333 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.842929974e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.549469366e-14 0.01774948722 58 0
14561 O 9.053333333 1.666666667 8.333333333 -1.607477176e-15 -3.567044484e-16 -0.0005547061447 -1.028757612e-13 -2.282765788e-14 -0.03549897444 62 63
14662 H 9.773333333 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.848928587e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.551888006e-14 0.01774948722 61 0
14763 H 8.333333333 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.841185589e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54876603e-14 0.01774948722 61 0
14864 O 9.053333333 5 1.666666667 -1.595895071e-15 5.518275566e-16 -0.0005547061447 -1.021345528e-13 3.531475631e-14 -0.03549897444 65 66
14965 H 9.773333333 5 2.224666667 0.008368844759 -3.331911714e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343426803e-14 0.01774948722 64 0
15066 H 8.333333333 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.326864406e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.341391729e-14 0.01774948722 64 0
15167 O 9.053333333 5 5 -1.583965117e-15 5.534974186e-16 -0.0005547061447 -1.013710834e-13 3.54216208e-14 -0.03549897444 68 69
15268 H 9.773333333 5 5.558 0.008368844759 -3.343096656e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.347936572e-14 0.01774948722 67 0
15369 H 8.333333333 5 5.558 -0.008368844759 -3.342183552e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.347568408e-14 0.01774948722 67 0
15470 O 9.053333333 5 8.333333333 -1.579960375e-15 5.527658608e-16 -0.0005547061447 -1.01114796e-13 3.537480403e-14 -0.03549897444 71 72
15571 H 9.773333333 5 8.891333333 0.008368844759 -3.337080344e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.345510795e-14 0.01774948722 70 0
15672 H 8.333333333 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.336588563e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.345312508e-14 0.01774948722 70 0
15773 O 9.053333333 8.333333333 1.666666667 -1.620406747e-15 1.1318638e-15 -0.0005547061447 -1.03703202e-13 7.243475574e-14 -0.03549897444 74 75
15874 H 9.773333333 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.361304701e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.355278055e-14 0.01774948722 73 0
15975 H 8.333333333 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.351772804e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.351434795e-14 0.01774948722 73 0
16076 O 9.053333333 8.333333333 5 -1.616329387e-15 1.130054846e-15 -0.0005547061447 -1.034422672e-13 7.231898994e-14 -0.03549897444 77 78
16177 H 9.773333333 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.33993359e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346661223e-14 0.01774948722 76 0
16278 H 8.333333333 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.34443216e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348475047e-14 0.01774948722 76 0
16379 O 9.053333333 8.333333333 8.333333333 -1.558992632e-15 1.13241126e-15 -0.0005547061447 -9.977294425e-14 7.246979101e-14 -0.03549897444 80 81
16480 H 9.773333333 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.363003736e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.355963107e-14 0.01774948722 79 0
16581 H 8.333333333 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.358763072e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.354253271e-14 0.01774948722 79 0
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.