| 1 | //
 | 
|---|
| 2 | // abstract.cc
 | 
|---|
| 3 | //
 | 
|---|
| 4 | // Copyright (C) 1996 Limit Point Systems, Inc.
 | 
|---|
| 5 | //
 | 
|---|
| 6 | // Author: Curtis Janssen <cljanss@limitpt.com>
 | 
|---|
| 7 | // Maintainer: LPS
 | 
|---|
| 8 | //
 | 
|---|
| 9 | // This file is part of the SC Toolkit.
 | 
|---|
| 10 | //
 | 
|---|
| 11 | // The SC Toolkit is free software; you can redistribute it and/or modify
 | 
|---|
| 12 | // it under the terms of the GNU Library General Public License as published by
 | 
|---|
| 13 | // the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
 | 
|---|
| 14 | // any later version.
 | 
|---|
| 15 | //
 | 
|---|
| 16 | // The SC Toolkit is distributed in the hope that it will be useful,
 | 
|---|
| 17 | // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
 | 
|---|
| 18 | // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
 | 
|---|
| 19 | // GNU Library General Public License for more details.
 | 
|---|
| 20 | //
 | 
|---|
| 21 | // You should have received a copy of the GNU Library General Public License
 | 
|---|
| 22 | // along with the SC Toolkit; see the file COPYING.LIB.  If not, write to
 | 
|---|
| 23 | // the Free Software Foundation, 675 Mass Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
 | 
|---|
| 24 | //
 | 
|---|
| 25 | // The U.S. Government is granted a limited license as per AL 91-7.
 | 
|---|
| 26 | //
 | 
|---|
| 27 | 
 | 
|---|
| 28 | #ifdef __GNUC__
 | 
|---|
| 29 | #pragma implementation
 | 
|---|
| 30 | #endif
 | 
|---|
| 31 | 
 | 
|---|
| 32 | #include <math.h>
 | 
|---|
| 33 | 
 | 
|---|
| 34 | #include <util/misc/formio.h>
 | 
|---|
| 35 | #include <util/state/stateio.h>
 | 
|---|
| 36 | #include <math/scmat/matrix.h>
 | 
|---|
| 37 | #include <math/scmat/blkiter.h>
 | 
|---|
| 38 | #include <math/scmat/elemop.h>
 | 
|---|
| 39 | 
 | 
|---|
| 40 | using namespace std;
 | 
|---|
| 41 | using namespace sc;
 | 
|---|
| 42 | 
 | 
|---|
| 43 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 44 | // These member are used by the abstract SCMatrix classes.
 | 
|---|
| 45 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 46 | 
 | 
|---|
| 47 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 48 | // SCMatrixKit members
 | 
|---|
| 49 | 
 | 
|---|
| 50 | static ClassDesc SCMatrixKit_cd(
 | 
|---|
| 51 |   typeid(SCMatrixKit),"SCMatrixKit",1,"public DescribedClass",
 | 
|---|
| 52 |   0, 0, 0);
 | 
|---|
| 53 | 
 | 
|---|
| 54 | SCMatrixKit::SCMatrixKit()
 | 
|---|
| 55 | {
 | 
|---|
| 56 |   grp_ = MessageGrp::get_default_messagegrp();
 | 
|---|
| 57 | }
 | 
|---|
| 58 | 
 | 
|---|
| 59 | SCMatrixKit::SCMatrixKit(const Ref<KeyVal>& keyval)
 | 
|---|
| 60 | {
 | 
|---|
| 61 |   grp_ << keyval->describedclassvalue("messagegrp");
 | 
|---|
| 62 |   if (grp_.null()) grp_ = MessageGrp::get_default_messagegrp();
 | 
|---|
| 63 | }
 | 
|---|
| 64 | 
 | 
|---|
| 65 | SCMatrixKit::~SCMatrixKit()
 | 
|---|
| 66 | {
 | 
|---|
| 67 | }
 | 
|---|
| 68 | 
 | 
|---|
| 69 | SCMatrix*
 | 
|---|
| 70 | SCMatrixKit::restore_matrix(StateIn& s,
 | 
|---|
| 71 |                             const RefSCDimension& d1,
 | 
|---|
| 72 |                             const RefSCDimension& d2)
 | 
|---|
| 73 | {
 | 
|---|
| 74 |   SCMatrix *r = matrix(d1,d2);
 | 
|---|
| 75 |   r->restore(s);
 | 
|---|
| 76 |   return r;
 | 
|---|
| 77 | }
 | 
|---|
| 78 | 
 | 
|---|
| 79 | SymmSCMatrix*
 | 
|---|
| 80 | SCMatrixKit::restore_symmmatrix(StateIn& s, const RefSCDimension& d)
 | 
|---|
| 81 | {
 | 
|---|
| 82 |   SymmSCMatrix *r = symmmatrix(d);
 | 
|---|
| 83 |   r->restore(s);
 | 
|---|
| 84 |   return r;
 | 
|---|
| 85 | }
 | 
|---|
| 86 | 
 | 
|---|
| 87 | DiagSCMatrix*
 | 
|---|
| 88 | SCMatrixKit::restore_diagmatrix(StateIn& s, const RefSCDimension& d)
 | 
|---|
| 89 | {
 | 
|---|
| 90 |   DiagSCMatrix *r = diagmatrix(d);
 | 
|---|
| 91 |   r->restore(s);
 | 
|---|
| 92 |   return r;
 | 
|---|
| 93 | }
 | 
|---|
| 94 | 
 | 
|---|
| 95 | SCVector*
 | 
|---|
| 96 | SCMatrixKit::restore_vector(StateIn& s, const RefSCDimension& d)
 | 
|---|
| 97 | {
 | 
|---|
| 98 |   SCVector *r = vector(d);
 | 
|---|
| 99 |   r->restore(s);
 | 
|---|
| 100 |   return r;
 | 
|---|
| 101 | }
 | 
|---|
| 102 | 
 | 
|---|
| 103 | Ref<MessageGrp>
 | 
|---|
| 104 | SCMatrixKit::messagegrp() const
 | 
|---|
| 105 | {
 | 
|---|
| 106 |   return grp_;
 | 
|---|
| 107 | }
 | 
|---|
| 108 | 
 | 
|---|
| 109 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 110 | // SCMatrix members
 | 
|---|
| 111 | 
 | 
|---|
| 112 | static ClassDesc SCMatrix_cd(
 | 
|---|
| 113 |   typeid(SCMatrix),"SCMatrix",1,"public DescribedClass",
 | 
|---|
| 114 |   0, 0, 0);
 | 
|---|
| 115 | 
 | 
|---|
| 116 | SCMatrix::SCMatrix(const RefSCDimension&a1, const RefSCDimension&a2,
 | 
|---|
| 117 |                    SCMatrixKit*kit):
 | 
|---|
| 118 |   d1(a1),
 | 
|---|
| 119 |   d2(a2),
 | 
|---|
| 120 |   kit_(kit)
 | 
|---|
| 121 | {
 | 
|---|
| 122 | }
 | 
|---|
| 123 | 
 | 
|---|
| 124 | SCMatrix::~SCMatrix()
 | 
|---|
| 125 | {
 | 
|---|
| 126 | }
 | 
|---|
| 127 | 
 | 
|---|
| 128 | void
 | 
|---|
| 129 | SCMatrix::save(StateOut&s)
 | 
|---|
| 130 | {
 | 
|---|
| 131 |   int nr = nrow();
 | 
|---|
| 132 |   int nc = ncol();
 | 
|---|
| 133 |   s.put(nr);
 | 
|---|
| 134 |   s.put(nc);
 | 
|---|
| 135 |   int has_subblocks = 0;
 | 
|---|
| 136 |   s.put(has_subblocks);
 | 
|---|
| 137 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 138 |       for (int j=0; j<nc; j++) {
 | 
|---|
| 139 |           s.put(get_element(i,j));
 | 
|---|
| 140 |         }
 | 
|---|
| 141 |     }
 | 
|---|
| 142 | }
 | 
|---|
| 143 | 
 | 
|---|
| 144 | void
 | 
|---|
| 145 | SCMatrix::restore(StateIn& s)
 | 
|---|
| 146 | {
 | 
|---|
| 147 |   int nrt, nr = nrow();
 | 
|---|
| 148 |   int nct, nc = ncol();
 | 
|---|
| 149 |   s.get(nrt);
 | 
|---|
| 150 |   s.get(nct);
 | 
|---|
| 151 |   if (nrt != nr || nct != nc) {
 | 
|---|
| 152 |       ExEnv::errn() << "SCMatrix::restore(): bad dimensions" << endl;
 | 
|---|
| 153 |       abort();
 | 
|---|
| 154 |     }
 | 
|---|
| 155 |   int has_subblocks;
 | 
|---|
| 156 |   s.get(has_subblocks);
 | 
|---|
| 157 |   if (!has_subblocks) {
 | 
|---|
| 158 |       for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 159 |           for (int j=0; j<nc; j++) {
 | 
|---|
| 160 |               double tmp;
 | 
|---|
| 161 |               s.get(tmp);
 | 
|---|
| 162 |               set_element(i,j, tmp);
 | 
|---|
| 163 |             }
 | 
|---|
| 164 |         }
 | 
|---|
| 165 |     }
 | 
|---|
| 166 |   else {
 | 
|---|
| 167 |       ExEnv::errn() << "SCMatrix::restore(): matrix has subblocks--cannot restore"
 | 
|---|
| 168 |            << endl;
 | 
|---|
| 169 |       abort();
 | 
|---|
| 170 |     }
 | 
|---|
| 171 | }
 | 
|---|
| 172 | 
 | 
|---|
| 173 | double
 | 
|---|
| 174 | SCMatrix::maxabs() const
 | 
|---|
| 175 | {
 | 
|---|
| 176 |   Ref<SCElementMaxAbs> op = new SCElementMaxAbs();
 | 
|---|
| 177 |   Ref<SCElementOp> abop = op.pointer();
 | 
|---|
| 178 |   ((SCMatrix *)this)->element_op(abop);
 | 
|---|
| 179 |   return op->result();
 | 
|---|
| 180 | }
 | 
|---|
| 181 | 
 | 
|---|
| 182 | void
 | 
|---|
| 183 | SCMatrix::randomize()
 | 
|---|
| 184 | {
 | 
|---|
| 185 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementRandomize();
 | 
|---|
| 186 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 187 | }
 | 
|---|
| 188 | 
 | 
|---|
| 189 | void
 | 
|---|
| 190 | SCMatrix::assign_val(double a)
 | 
|---|
| 191 | {
 | 
|---|
| 192 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAssign(a);
 | 
|---|
| 193 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 194 | }
 | 
|---|
| 195 | 
 | 
|---|
| 196 | void
 | 
|---|
| 197 | SCMatrix::scale(double a)
 | 
|---|
| 198 | {
 | 
|---|
| 199 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScale(a);
 | 
|---|
| 200 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 201 | }
 | 
|---|
| 202 | 
 | 
|---|
| 203 | void
 | 
|---|
| 204 | SCMatrix::scale_diagonal(double a)
 | 
|---|
| 205 | {
 | 
|---|
| 206 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScaleDiagonal(a);
 | 
|---|
| 207 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 208 | }
 | 
|---|
| 209 | 
 | 
|---|
| 210 | void
 | 
|---|
| 211 | SCMatrix::shift_diagonal(double a)
 | 
|---|
| 212 | {
 | 
|---|
| 213 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementShiftDiagonal(a);
 | 
|---|
| 214 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 215 | }
 | 
|---|
| 216 | 
 | 
|---|
| 217 | void
 | 
|---|
| 218 | SCMatrix::unit()
 | 
|---|
| 219 | {
 | 
|---|
| 220 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 221 |   this->shift_diagonal(1.0);
 | 
|---|
| 222 | }
 | 
|---|
| 223 | 
 | 
|---|
| 224 | void
 | 
|---|
| 225 | SCMatrix::assign_r(SCMatrix*a)
 | 
|---|
| 226 | {
 | 
|---|
| 227 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 228 |   this->accumulate(a);
 | 
|---|
| 229 | }
 | 
|---|
| 230 | 
 | 
|---|
| 231 | void
 | 
|---|
| 232 | SCMatrix::assign_p(const double*a)
 | 
|---|
| 233 | {
 | 
|---|
| 234 |   int i;
 | 
|---|
| 235 |   int nr = nrow();
 | 
|---|
| 236 |   int nc = ncol();
 | 
|---|
| 237 |   // some compilers need the following cast
 | 
|---|
| 238 |   const double **v = (const double**) new double*[nr];
 | 
|---|
| 239 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 240 |       v[i] = &a[i*nc];
 | 
|---|
| 241 |     }
 | 
|---|
| 242 |   assign(v);
 | 
|---|
| 243 |   delete[] v;
 | 
|---|
| 244 | }
 | 
|---|
| 245 | 
 | 
|---|
| 246 | void
 | 
|---|
| 247 | SCMatrix::assign_pp(const double**a)
 | 
|---|
| 248 | {
 | 
|---|
| 249 |   int i;
 | 
|---|
| 250 |   int j;
 | 
|---|
| 251 |   int nr;
 | 
|---|
| 252 |   int nc;
 | 
|---|
| 253 |   nr = nrow();
 | 
|---|
| 254 |   nc = ncol();
 | 
|---|
| 255 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 256 |       for (j=0; j<nc; j++) {
 | 
|---|
| 257 |           set_element(i,j,a[i][j]);
 | 
|---|
| 258 |         }
 | 
|---|
| 259 |     }
 | 
|---|
| 260 | }
 | 
|---|
| 261 | 
 | 
|---|
| 262 | void
 | 
|---|
| 263 | SCMatrix::convert(SCMatrix*a)
 | 
|---|
| 264 | {
 | 
|---|
| 265 |   assign(0.0);
 | 
|---|
| 266 |   convert_accumulate(a);
 | 
|---|
| 267 | }
 | 
|---|
| 268 | 
 | 
|---|
| 269 | void
 | 
|---|
| 270 | SCMatrix::convert_accumulate(SCMatrix*a)
 | 
|---|
| 271 | {
 | 
|---|
| 272 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAccumulateSCMatrix(a);
 | 
|---|
| 273 |   element_op(op);
 | 
|---|
| 274 | }
 | 
|---|
| 275 | 
 | 
|---|
| 276 | void
 | 
|---|
| 277 | SCMatrix::convert(double*a) const
 | 
|---|
| 278 | {
 | 
|---|
| 279 |   int i;
 | 
|---|
| 280 |   int nr = nrow();
 | 
|---|
| 281 |   int nc = ncol();
 | 
|---|
| 282 |   double **v = new double*[nr];
 | 
|---|
| 283 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 284 |       v[i] = &a[i*nc];
 | 
|---|
| 285 |     }
 | 
|---|
| 286 |   convert(v);
 | 
|---|
| 287 |   delete[] v;
 | 
|---|
| 288 | }
 | 
|---|
| 289 | 
 | 
|---|
| 290 | void
 | 
|---|
| 291 | SCMatrix::convert(double**a) const
 | 
|---|
| 292 | {
 | 
|---|
| 293 |   int i, j;
 | 
|---|
| 294 |   int nr, nc;
 | 
|---|
| 295 |   nr = nrow();
 | 
|---|
| 296 |   nc = ncol();
 | 
|---|
| 297 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 298 |       for (j=0; j<nc; j++) {
 | 
|---|
| 299 |           a[i][j] = get_element(i,j);
 | 
|---|
| 300 |         }
 | 
|---|
| 301 |     }
 | 
|---|
| 302 | }
 | 
|---|
| 303 | 
 | 
|---|
| 304 | void
 | 
|---|
| 305 | SCMatrix::accumulate_product_sr(SymmSCMatrix*a,SCMatrix*b)
 | 
|---|
| 306 | {
 | 
|---|
| 307 |   SCMatrix *t = b->copy();
 | 
|---|
| 308 |   t->transpose_this();
 | 
|---|
| 309 |   SCMatrix *t2 = this->copy();
 | 
|---|
| 310 |   t2->transpose_this();
 | 
|---|
| 311 |   t2->accumulate_product(t,a);
 | 
|---|
| 312 |   delete t;
 | 
|---|
| 313 |   t2->transpose_this();
 | 
|---|
| 314 |   assign(t2);
 | 
|---|
| 315 |   delete t2;
 | 
|---|
| 316 | }
 | 
|---|
| 317 | 
 | 
|---|
| 318 | void
 | 
|---|
| 319 | SCMatrix::accumulate_product_dr(DiagSCMatrix*a,SCMatrix*b)
 | 
|---|
| 320 | {
 | 
|---|
| 321 |   SCMatrix *t = b->copy();
 | 
|---|
| 322 |   t->transpose_this();
 | 
|---|
| 323 |   SCMatrix *t2 = kit()->matrix(coldim(),rowdim());
 | 
|---|
| 324 |   t2->assign(0.0);
 | 
|---|
| 325 |   t2->accumulate_product(t,a);
 | 
|---|
| 326 |   delete t;
 | 
|---|
| 327 |   t2->transpose_this();
 | 
|---|
| 328 |   accumulate(t2);
 | 
|---|
| 329 |   delete t2;
 | 
|---|
| 330 | }
 | 
|---|
| 331 | 
 | 
|---|
| 332 | void
 | 
|---|
| 333 | SCMatrix::print(ostream&o) const
 | 
|---|
| 334 | {
 | 
|---|
| 335 |   vprint(0, o, 10);
 | 
|---|
| 336 | }
 | 
|---|
| 337 | 
 | 
|---|
| 338 | void
 | 
|---|
| 339 | SCMatrix::print(const char *t, ostream&o, int i) const
 | 
|---|
| 340 | {
 | 
|---|
| 341 |   vprint(t, o, i);
 | 
|---|
| 342 | }
 | 
|---|
| 343 | 
 | 
|---|
| 344 | SCMatrix*
 | 
|---|
| 345 | SCMatrix::clone()
 | 
|---|
| 346 | {
 | 
|---|
| 347 |   return kit()->matrix(rowdim(),coldim());
 | 
|---|
| 348 | }
 | 
|---|
| 349 | 
 | 
|---|
| 350 | SCMatrix*
 | 
|---|
| 351 | SCMatrix::copy()
 | 
|---|
| 352 | {
 | 
|---|
| 353 |   SCMatrix* result = clone();
 | 
|---|
| 354 |   result->assign(this);
 | 
|---|
| 355 |   return result;
 | 
|---|
| 356 | }
 | 
|---|
| 357 | 
 | 
|---|
| 358 | void
 | 
|---|
| 359 | SCMatrix::gen_invert_this()
 | 
|---|
| 360 | {
 | 
|---|
| 361 |   int i;
 | 
|---|
| 362 | 
 | 
|---|
| 363 |   // Compute the singular value decomposition of this
 | 
|---|
| 364 |   RefSCMatrix U(rowdim(),rowdim(),kit());
 | 
|---|
| 365 |   RefSCMatrix V(coldim(),coldim(),kit());
 | 
|---|
| 366 |   RefSCDimension min;
 | 
|---|
| 367 |   if (coldim().n()<rowdim().n()) min = coldim();
 | 
|---|
| 368 |   else min = rowdim();
 | 
|---|
| 369 |   int nmin = min.n();
 | 
|---|
| 370 |   RefDiagSCMatrix sigma(min,kit());
 | 
|---|
| 371 |   svd_this(U.pointer(),sigma.pointer(),V.pointer());
 | 
|---|
| 372 | 
 | 
|---|
| 373 |   // compute the epsilon rank of this
 | 
|---|
| 374 |   int rank = 0;
 | 
|---|
| 375 |   for (i=0; i<nmin; i++) {
 | 
|---|
| 376 |       if (fabs(sigma(i)) > 0.0000001) rank++;
 | 
|---|
| 377 |     }
 | 
|---|
| 378 | 
 | 
|---|
| 379 |   RefSCDimension drank = new SCDimension(rank);
 | 
|---|
| 380 |   RefDiagSCMatrix sigma_i(drank,kit());
 | 
|---|
| 381 |   for (i=0; i<rank; i++) {
 | 
|---|
| 382 |       sigma_i(i) = 1.0/sigma(i);
 | 
|---|
| 383 |     }
 | 
|---|
| 384 |   RefSCMatrix Ur(rowdim(), drank, kit());
 | 
|---|
| 385 |   RefSCMatrix Vr(coldim(), drank, kit());
 | 
|---|
| 386 |   Ur.assign_subblock(U,0, rowdim().n()-1, 0, drank.n()-1, 0, 0);
 | 
|---|
| 387 |   Vr.assign_subblock(V,0, coldim().n()-1, 0, drank.n()-1, 0, 0);
 | 
|---|
| 388 |   assign((Vr * sigma_i * Ur.t()).t());
 | 
|---|
| 389 |   transpose_this();
 | 
|---|
| 390 | }
 | 
|---|
| 391 | 
 | 
|---|
| 392 | void
 | 
|---|
| 393 | SCMatrix::svd_this(SCMatrix *U, DiagSCMatrix *sigma, SCMatrix *V)
 | 
|---|
| 394 | {
 | 
|---|
| 395 |   ExEnv::errn() << indent << class_name() << ": SVD not implemented\n";
 | 
|---|
| 396 |   abort();
 | 
|---|
| 397 | }
 | 
|---|
| 398 | 
 | 
|---|
| 399 | void
 | 
|---|
| 400 | SCMatrix::accumulate_product_rs(SCMatrix*a,SymmSCMatrix*b)
 | 
|---|
| 401 | {
 | 
|---|
| 402 |   SCMatrix *brect = kit()->matrix(b->dim(),b->dim());
 | 
|---|
| 403 |   brect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 404 |   brect->accumulate(b);
 | 
|---|
| 405 |   accumulate_product(a,brect);
 | 
|---|
| 406 |   delete brect;
 | 
|---|
| 407 | }
 | 
|---|
| 408 | 
 | 
|---|
| 409 | void
 | 
|---|
| 410 | SCMatrix::accumulate_product_ss(SymmSCMatrix*a,SymmSCMatrix*b)
 | 
|---|
| 411 | {
 | 
|---|
| 412 |   SCMatrix *arect = kit()->matrix(a->dim(),a->dim());
 | 
|---|
| 413 |   arect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 414 |   arect->accumulate(a);
 | 
|---|
| 415 |   SCMatrix *brect = kit()->matrix(b->dim(),b->dim());
 | 
|---|
| 416 |   brect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 417 |   brect->accumulate(b);
 | 
|---|
| 418 |   accumulate_product(arect,brect);
 | 
|---|
| 419 |   delete arect;
 | 
|---|
| 420 |   delete brect;
 | 
|---|
| 421 | }
 | 
|---|
| 422 | 
 | 
|---|
| 423 | void
 | 
|---|
| 424 | SCMatrix::accumulate_product_rd(SCMatrix*a,DiagSCMatrix*b)
 | 
|---|
| 425 | {
 | 
|---|
| 426 |   SCMatrix *brect = kit()->matrix(b->dim(),b->dim());
 | 
|---|
| 427 |   brect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 428 |   brect->accumulate(b);
 | 
|---|
| 429 |   accumulate_product(a,brect);
 | 
|---|
| 430 |   delete brect;
 | 
|---|
| 431 | }
 | 
|---|
| 432 | 
 | 
|---|
| 433 | Ref<MessageGrp>
 | 
|---|
| 434 | SCMatrix::messagegrp() const
 | 
|---|
| 435 | {
 | 
|---|
| 436 |   return kit_->messagegrp();
 | 
|---|
| 437 | }
 | 
|---|
| 438 | 
 | 
|---|
| 439 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 440 | // SymmSCMatrix member functions
 | 
|---|
| 441 | 
 | 
|---|
| 442 | static ClassDesc SymmSCMatrix_cd(
 | 
|---|
| 443 |   typeid(SymmSCMatrix),"SymmSCMatrix",1,"public DescribedClass",
 | 
|---|
| 444 |   0, 0, 0);
 | 
|---|
| 445 | 
 | 
|---|
| 446 | SymmSCMatrix::SymmSCMatrix(const RefSCDimension&a, SCMatrixKit *kit):
 | 
|---|
| 447 |   d(a),
 | 
|---|
| 448 |   kit_(kit)
 | 
|---|
| 449 | {
 | 
|---|
| 450 | }
 | 
|---|
| 451 | 
 | 
|---|
| 452 | SymmSCMatrix::~SymmSCMatrix()
 | 
|---|
| 453 | {
 | 
|---|
| 454 | }
 | 
|---|
| 455 | 
 | 
|---|
| 456 | void
 | 
|---|
| 457 | SymmSCMatrix::save(StateOut&s)
 | 
|---|
| 458 | {
 | 
|---|
| 459 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 460 |   s.put(nr);
 | 
|---|
| 461 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 462 |       for (int j=0; j<=i; j++) {
 | 
|---|
| 463 |           s.put(get_element(i,j));
 | 
|---|
| 464 |         }
 | 
|---|
| 465 |     }
 | 
|---|
| 466 | }
 | 
|---|
| 467 | 
 | 
|---|
| 468 | void
 | 
|---|
| 469 | SymmSCMatrix::restore(StateIn& s)
 | 
|---|
| 470 | {
 | 
|---|
| 471 |   int nrt, nr = n();
 | 
|---|
| 472 |   s.get(nrt);
 | 
|---|
| 473 |   if (nrt != nr) {
 | 
|---|
| 474 |       ExEnv::errn() << "SymmSCMatrix::restore(): bad dimension" << endl;
 | 
|---|
| 475 |       abort();
 | 
|---|
| 476 |     }
 | 
|---|
| 477 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 478 |       for (int j=0; j<=i; j++) {
 | 
|---|
| 479 |           double tmp;
 | 
|---|
| 480 |           s.get(tmp);
 | 
|---|
| 481 |           set_element(i,j, tmp);
 | 
|---|
| 482 |         }
 | 
|---|
| 483 |     }
 | 
|---|
| 484 | }
 | 
|---|
| 485 | 
 | 
|---|
| 486 | double
 | 
|---|
| 487 | SymmSCMatrix::maxabs() const
 | 
|---|
| 488 | {
 | 
|---|
| 489 |   Ref<SCElementMaxAbs> op = new SCElementMaxAbs();
 | 
|---|
| 490 |   Ref<SCElementOp> abop = op.pointer();
 | 
|---|
| 491 |   ((SymmSCMatrix*)this)->element_op(abop);
 | 
|---|
| 492 |   return op->result();
 | 
|---|
| 493 | }
 | 
|---|
| 494 | 
 | 
|---|
| 495 | void
 | 
|---|
| 496 | SymmSCMatrix::randomize()
 | 
|---|
| 497 | {
 | 
|---|
| 498 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementRandomize();
 | 
|---|
| 499 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 500 | }
 | 
|---|
| 501 | 
 | 
|---|
| 502 | void
 | 
|---|
| 503 | SymmSCMatrix::assign_val(double a)
 | 
|---|
| 504 | {
 | 
|---|
| 505 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAssign(a);
 | 
|---|
| 506 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 507 | }
 | 
|---|
| 508 | 
 | 
|---|
| 509 | void
 | 
|---|
| 510 | SymmSCMatrix::assign_p(const double*a)
 | 
|---|
| 511 | {
 | 
|---|
| 512 |   int i;
 | 
|---|
| 513 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 514 |   // some compilers need the following cast
 | 
|---|
| 515 |   const double **v = (const double **) new double*[nr];
 | 
|---|
| 516 |   int ioff= 0;
 | 
|---|
| 517 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 518 |       ioff += i;
 | 
|---|
| 519 |       v[i] = &a[ioff];
 | 
|---|
| 520 | //    ioff += i;
 | 
|---|
| 521 |     }
 | 
|---|
| 522 |   assign(v);
 | 
|---|
| 523 |   delete[] v;
 | 
|---|
| 524 | }
 | 
|---|
| 525 | 
 | 
|---|
| 526 | void
 | 
|---|
| 527 | SymmSCMatrix::assign_pp(const double**a)
 | 
|---|
| 528 | {
 | 
|---|
| 529 |   int i;
 | 
|---|
| 530 |   int j;
 | 
|---|
| 531 |   int nr;
 | 
|---|
| 532 |   nr = n();
 | 
|---|
| 533 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 534 |       for (j=0; j<=i; j++) {
 | 
|---|
| 535 |           set_element(i,j,a[i][j]);
 | 
|---|
| 536 |         }
 | 
|---|
| 537 |     }
 | 
|---|
| 538 | }
 | 
|---|
| 539 | 
 | 
|---|
| 540 | void
 | 
|---|
| 541 | SymmSCMatrix::convert(SymmSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 542 | {
 | 
|---|
| 543 |   assign(0.0);
 | 
|---|
| 544 |   convert_accumulate(a);
 | 
|---|
| 545 | }
 | 
|---|
| 546 | 
 | 
|---|
| 547 | void
 | 
|---|
| 548 | SymmSCMatrix::convert_accumulate(SymmSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 549 | {
 | 
|---|
| 550 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAccumulateSymmSCMatrix(a);
 | 
|---|
| 551 |   element_op(op);
 | 
|---|
| 552 | }
 | 
|---|
| 553 | 
 | 
|---|
| 554 | void
 | 
|---|
| 555 | SymmSCMatrix::convert(double*a) const
 | 
|---|
| 556 | {
 | 
|---|
| 557 |   int i;
 | 
|---|
| 558 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 559 |   double **v = new double*[nr];
 | 
|---|
| 560 |   int ioff= 0;
 | 
|---|
| 561 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 562 |       ioff += i;
 | 
|---|
| 563 |       v[i] = &a[ioff];
 | 
|---|
| 564 | //    ioff += i;
 | 
|---|
| 565 |     }
 | 
|---|
| 566 |   convert(v);
 | 
|---|
| 567 |   delete[] v;
 | 
|---|
| 568 | }
 | 
|---|
| 569 | 
 | 
|---|
| 570 | void
 | 
|---|
| 571 | SymmSCMatrix::convert(double**a) const
 | 
|---|
| 572 | {
 | 
|---|
| 573 |   int i;
 | 
|---|
| 574 |   int j;
 | 
|---|
| 575 |   int nr;
 | 
|---|
| 576 |   nr = n();
 | 
|---|
| 577 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 578 |       for (j=0; j<=i; j++) {
 | 
|---|
| 579 |           a[i][j] = get_element(i,j);
 | 
|---|
| 580 |         }
 | 
|---|
| 581 |     }
 | 
|---|
| 582 | }
 | 
|---|
| 583 | 
 | 
|---|
| 584 | void
 | 
|---|
| 585 | SymmSCMatrix::scale(double a)
 | 
|---|
| 586 | {
 | 
|---|
| 587 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScale(a);
 | 
|---|
| 588 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 589 | }
 | 
|---|
| 590 | 
 | 
|---|
| 591 | void
 | 
|---|
| 592 | SymmSCMatrix::scale_diagonal(double a)
 | 
|---|
| 593 | {
 | 
|---|
| 594 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScaleDiagonal(a);
 | 
|---|
| 595 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 596 | }
 | 
|---|
| 597 | 
 | 
|---|
| 598 | void
 | 
|---|
| 599 | SymmSCMatrix::shift_diagonal(double a)
 | 
|---|
| 600 | {
 | 
|---|
| 601 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementShiftDiagonal(a);
 | 
|---|
| 602 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 603 | }
 | 
|---|
| 604 | 
 | 
|---|
| 605 | void
 | 
|---|
| 606 | SymmSCMatrix::unit()
 | 
|---|
| 607 | {
 | 
|---|
| 608 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 609 |   this->shift_diagonal(1.0);
 | 
|---|
| 610 | }
 | 
|---|
| 611 | 
 | 
|---|
| 612 | void
 | 
|---|
| 613 | SymmSCMatrix::assign_s(SymmSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 614 | {
 | 
|---|
| 615 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 616 |   this->accumulate(a);
 | 
|---|
| 617 | }
 | 
|---|
| 618 | 
 | 
|---|
| 619 | void
 | 
|---|
| 620 | SymmSCMatrix::print(ostream&o) const
 | 
|---|
| 621 | {
 | 
|---|
| 622 |   vprint(0, o, 10);
 | 
|---|
| 623 | }
 | 
|---|
| 624 | 
 | 
|---|
| 625 | void
 | 
|---|
| 626 | SymmSCMatrix::print(const char *t, ostream&o, int i) const
 | 
|---|
| 627 | {
 | 
|---|
| 628 |   vprint(t, o, i);
 | 
|---|
| 629 | }
 | 
|---|
| 630 | 
 | 
|---|
| 631 | void
 | 
|---|
| 632 | SymmSCMatrix::vprint(const char* title, ostream& out, int i) const
 | 
|---|
| 633 | {
 | 
|---|
| 634 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 635 |   m->assign(0.0);
 | 
|---|
| 636 |   m->accumulate(this);
 | 
|---|
| 637 |   m->print(title, out, i);
 | 
|---|
| 638 | }
 | 
|---|
| 639 | 
 | 
|---|
| 640 | SymmSCMatrix*
 | 
|---|
| 641 | SymmSCMatrix::clone()
 | 
|---|
| 642 | {
 | 
|---|
| 643 |   return kit()->symmmatrix(dim());
 | 
|---|
| 644 | }
 | 
|---|
| 645 | 
 | 
|---|
| 646 | SymmSCMatrix*
 | 
|---|
| 647 | SymmSCMatrix::copy()
 | 
|---|
| 648 | {
 | 
|---|
| 649 |   SymmSCMatrix* result = clone();
 | 
|---|
| 650 |   result->assign(this);
 | 
|---|
| 651 |   return result;
 | 
|---|
| 652 | }
 | 
|---|
| 653 | 
 | 
|---|
| 654 | void
 | 
|---|
| 655 | SymmSCMatrix::accumulate_symmetric_product(SCMatrix *a)
 | 
|---|
| 656 | {
 | 
|---|
| 657 |   RefSCMatrix at = a->copy();
 | 
|---|
| 658 |   at->transpose_this();
 | 
|---|
| 659 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(a->rowdim(),a->rowdim());
 | 
|---|
| 660 |   m->assign(0.0);
 | 
|---|
| 661 |   m->accumulate_product(a, at.pointer());
 | 
|---|
| 662 |   scale(2.0);
 | 
|---|
| 663 |   accumulate_symmetric_sum(m.pointer());
 | 
|---|
| 664 |   scale(0.5);
 | 
|---|
| 665 | }
 | 
|---|
| 666 | 
 | 
|---|
| 667 | void
 | 
|---|
| 668 | SymmSCMatrix::accumulate_transform(SCMatrix *a, SymmSCMatrix *b,
 | 
|---|
| 669 |                                    SCMatrix::Transform t)
 | 
|---|
| 670 | {
 | 
|---|
| 671 |   RefSCMatrix brect = kit()->matrix(b->dim(),b->dim());
 | 
|---|
| 672 |   brect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 673 |   brect->accumulate(b);
 | 
|---|
| 674 | 
 | 
|---|
| 675 |   RefSCMatrix res;
 | 
|---|
| 676 | 
 | 
|---|
| 677 |   if (t == SCMatrix::TransposeTransform) {
 | 
|---|
| 678 |       RefSCMatrix at = a->copy();
 | 
|---|
| 679 |       at->transpose_this();
 | 
|---|
| 680 | 
 | 
|---|
| 681 |       RefSCMatrix tmp = at->clone();
 | 
|---|
| 682 |       tmp->assign(0.0);
 | 
|---|
| 683 | 
 | 
|---|
| 684 |       tmp->accumulate_product(at.pointer(), brect.pointer());
 | 
|---|
| 685 |       brect = 0;
 | 
|---|
| 686 |       at = 0;
 | 
|---|
| 687 | 
 | 
|---|
| 688 |       res = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 689 |       res->assign(0.0);
 | 
|---|
| 690 |       res->accumulate_product(tmp.pointer(), a);
 | 
|---|
| 691 |     }
 | 
|---|
| 692 |   else {
 | 
|---|
| 693 |       RefSCMatrix tmp = a->clone();
 | 
|---|
| 694 |       tmp->assign(0.0);
 | 
|---|
| 695 | 
 | 
|---|
| 696 |       tmp->accumulate_product(a,brect);
 | 
|---|
| 697 |       brect = 0;
 | 
|---|
| 698 | 
 | 
|---|
| 699 |       RefSCMatrix at = a->copy();
 | 
|---|
| 700 |       at->transpose_this();
 | 
|---|
| 701 | 
 | 
|---|
| 702 |       res = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 703 |       res->assign(0.0);
 | 
|---|
| 704 |       res->accumulate_product(tmp.pointer(), at.pointer());
 | 
|---|
| 705 |       at = 0;
 | 
|---|
| 706 |     }
 | 
|---|
| 707 | 
 | 
|---|
| 708 |   scale(2.0);
 | 
|---|
| 709 |   accumulate_symmetric_sum(res.pointer());
 | 
|---|
| 710 |   scale(0.5);
 | 
|---|
| 711 | }
 | 
|---|
| 712 | 
 | 
|---|
| 713 | void
 | 
|---|
| 714 | SymmSCMatrix::accumulate_transform(SCMatrix *a, DiagSCMatrix *b,
 | 
|---|
| 715 |                                    SCMatrix::Transform t)
 | 
|---|
| 716 | {
 | 
|---|
| 717 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(a->rowdim(),a->rowdim());
 | 
|---|
| 718 |   RefSCMatrix brect = kit()->matrix(b->dim(),b->dim());
 | 
|---|
| 719 |   brect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 720 |   brect->accumulate(b);
 | 
|---|
| 721 | 
 | 
|---|
| 722 |   RefSCMatrix tmp = a->clone();
 | 
|---|
| 723 |   tmp->assign(0.0);
 | 
|---|
| 724 | 
 | 
|---|
| 725 |   RefSCMatrix res;
 | 
|---|
| 726 |   
 | 
|---|
| 727 |   if (t == SCMatrix::TransposeTransform) {
 | 
|---|
| 728 |       RefSCMatrix at = a->copy();
 | 
|---|
| 729 |       at->transpose_this();
 | 
|---|
| 730 | 
 | 
|---|
| 731 |       tmp->accumulate_product(at.pointer(), brect.pointer());
 | 
|---|
| 732 |       brect = 0;
 | 
|---|
| 733 |       at = 0;
 | 
|---|
| 734 | 
 | 
|---|
| 735 |       res = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 736 |       res->assign(0.0);
 | 
|---|
| 737 |       res->accumulate_product(tmp.pointer(), a);
 | 
|---|
| 738 |     }
 | 
|---|
| 739 |   else {
 | 
|---|
| 740 |       tmp->accumulate_product(a, brect.pointer());
 | 
|---|
| 741 |       brect = 0;
 | 
|---|
| 742 | 
 | 
|---|
| 743 |       RefSCMatrix at = a->copy();
 | 
|---|
| 744 |       at->transpose_this();
 | 
|---|
| 745 | 
 | 
|---|
| 746 |       res = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 747 |       res->assign(0.0);
 | 
|---|
| 748 |       res->accumulate_product(tmp.pointer(), at.pointer());
 | 
|---|
| 749 |       at = 0;
 | 
|---|
| 750 |     }
 | 
|---|
| 751 | 
 | 
|---|
| 752 |   tmp = 0;
 | 
|---|
| 753 | 
 | 
|---|
| 754 |   scale(2.0);
 | 
|---|
| 755 |   accumulate_symmetric_sum(res.pointer());
 | 
|---|
| 756 |   scale(0.5);
 | 
|---|
| 757 | }
 | 
|---|
| 758 | 
 | 
|---|
| 759 | void
 | 
|---|
| 760 | SymmSCMatrix::accumulate_transform(SymmSCMatrix *a, SymmSCMatrix *b)
 | 
|---|
| 761 | {
 | 
|---|
| 762 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(a->dim(),a->dim());
 | 
|---|
| 763 |   m->assign(0.0);
 | 
|---|
| 764 |   m->accumulate(a);
 | 
|---|
| 765 |   accumulate_transform(m.pointer(),b);
 | 
|---|
| 766 | }
 | 
|---|
| 767 | 
 | 
|---|
| 768 | void
 | 
|---|
| 769 | SymmSCMatrix::accumulate_symmetric_outer_product(SCVector *v)
 | 
|---|
| 770 | {
 | 
|---|
| 771 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 772 |   m->assign(0.0);
 | 
|---|
| 773 |   m->accumulate_outer_product(v,v);
 | 
|---|
| 774 | 
 | 
|---|
| 775 |   scale(2.0);
 | 
|---|
| 776 |   accumulate_symmetric_sum(m.pointer());
 | 
|---|
| 777 |   scale(0.5);
 | 
|---|
| 778 | }
 | 
|---|
| 779 | 
 | 
|---|
| 780 | double
 | 
|---|
| 781 | SymmSCMatrix::scalar_product(SCVector *v)
 | 
|---|
| 782 | {
 | 
|---|
| 783 |   RefSCVector v2 = kit()->vector(dim());
 | 
|---|
| 784 |   v2->assign(0.0);
 | 
|---|
| 785 |   v2->accumulate_product(this,v);
 | 
|---|
| 786 |   return v2->scalar_product(v);
 | 
|---|
| 787 | }
 | 
|---|
| 788 | 
 | 
|---|
| 789 | Ref<MessageGrp>
 | 
|---|
| 790 | SymmSCMatrix::messagegrp() const
 | 
|---|
| 791 | {
 | 
|---|
| 792 |   return kit_->messagegrp();
 | 
|---|
| 793 | }
 | 
|---|
| 794 | 
 | 
|---|
| 795 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 796 | // DiagSCMatrix member functions
 | 
|---|
| 797 | 
 | 
|---|
| 798 | static ClassDesc DiagSCMatrix_cd(
 | 
|---|
| 799 |   typeid(DiagSCMatrix),"DiagSCMatrix",1,"public DescribedClass",
 | 
|---|
| 800 |   0, 0, 0);
 | 
|---|
| 801 | 
 | 
|---|
| 802 | DiagSCMatrix::DiagSCMatrix(const RefSCDimension&a, SCMatrixKit *kit):
 | 
|---|
| 803 |   d(a),
 | 
|---|
| 804 |   kit_(kit)
 | 
|---|
| 805 | {
 | 
|---|
| 806 | }
 | 
|---|
| 807 | 
 | 
|---|
| 808 | DiagSCMatrix::~DiagSCMatrix()
 | 
|---|
| 809 | {
 | 
|---|
| 810 | }
 | 
|---|
| 811 | 
 | 
|---|
| 812 | void
 | 
|---|
| 813 | DiagSCMatrix::save(StateOut&s)
 | 
|---|
| 814 | {
 | 
|---|
| 815 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 816 |   s.put(nr);
 | 
|---|
| 817 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 818 |       s.put(get_element(i));
 | 
|---|
| 819 |     }
 | 
|---|
| 820 | }
 | 
|---|
| 821 | 
 | 
|---|
| 822 | void
 | 
|---|
| 823 | DiagSCMatrix::restore(StateIn& s)
 | 
|---|
| 824 | {
 | 
|---|
| 825 |   int nrt, nr = n();
 | 
|---|
| 826 |   s.get(nrt);
 | 
|---|
| 827 |   if (nrt != nr) {
 | 
|---|
| 828 |       ExEnv::errn() << "DiagSCMatrix::restore(): bad dimension" << endl;
 | 
|---|
| 829 |       abort();
 | 
|---|
| 830 |     }
 | 
|---|
| 831 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 832 |       double tmp;
 | 
|---|
| 833 |       s.get(tmp);
 | 
|---|
| 834 |       set_element(i, tmp);
 | 
|---|
| 835 |     }
 | 
|---|
| 836 | }
 | 
|---|
| 837 | 
 | 
|---|
| 838 | double
 | 
|---|
| 839 | DiagSCMatrix::maxabs() const
 | 
|---|
| 840 | {
 | 
|---|
| 841 |   Ref<SCElementMaxAbs> op = new SCElementMaxAbs();
 | 
|---|
| 842 |   Ref<SCElementOp> abop = op.pointer();
 | 
|---|
| 843 |   ((DiagSCMatrix*)this)->element_op(abop);
 | 
|---|
| 844 |   return op->result();
 | 
|---|
| 845 | }
 | 
|---|
| 846 | 
 | 
|---|
| 847 | void
 | 
|---|
| 848 | DiagSCMatrix::randomize()
 | 
|---|
| 849 | {
 | 
|---|
| 850 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementRandomize();
 | 
|---|
| 851 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 852 | }
 | 
|---|
| 853 | 
 | 
|---|
| 854 | void
 | 
|---|
| 855 | DiagSCMatrix::assign_val(double a)
 | 
|---|
| 856 | {
 | 
|---|
| 857 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAssign(a);
 | 
|---|
| 858 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 859 | }
 | 
|---|
| 860 | 
 | 
|---|
| 861 | void
 | 
|---|
| 862 | DiagSCMatrix::assign_p(const double*a)
 | 
|---|
| 863 | {
 | 
|---|
| 864 |   int i;
 | 
|---|
| 865 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 866 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 867 |       set_element(i,a[i]);
 | 
|---|
| 868 |     }
 | 
|---|
| 869 | }
 | 
|---|
| 870 | 
 | 
|---|
| 871 | void
 | 
|---|
| 872 | DiagSCMatrix::convert(DiagSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 873 | {
 | 
|---|
| 874 |   assign(0.0);
 | 
|---|
| 875 |   convert_accumulate(a);
 | 
|---|
| 876 | }
 | 
|---|
| 877 | 
 | 
|---|
| 878 | void
 | 
|---|
| 879 | DiagSCMatrix::convert_accumulate(DiagSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 880 | {
 | 
|---|
| 881 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAccumulateDiagSCMatrix(a);
 | 
|---|
| 882 |   element_op(op);
 | 
|---|
| 883 | }
 | 
|---|
| 884 | 
 | 
|---|
| 885 | void
 | 
|---|
| 886 | DiagSCMatrix::convert(double*a) const
 | 
|---|
| 887 | {
 | 
|---|
| 888 |   int i;
 | 
|---|
| 889 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 890 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 891 |       a[i] = get_element(i);
 | 
|---|
| 892 |     }
 | 
|---|
| 893 | }
 | 
|---|
| 894 | 
 | 
|---|
| 895 | void
 | 
|---|
| 896 | DiagSCMatrix::scale(double a)
 | 
|---|
| 897 | {
 | 
|---|
| 898 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScale(a);
 | 
|---|
| 899 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 900 | }
 | 
|---|
| 901 | 
 | 
|---|
| 902 | void
 | 
|---|
| 903 | DiagSCMatrix::assign_d(DiagSCMatrix*a)
 | 
|---|
| 904 | {
 | 
|---|
| 905 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 906 |   this->accumulate(a);
 | 
|---|
| 907 | }
 | 
|---|
| 908 | 
 | 
|---|
| 909 | void
 | 
|---|
| 910 | DiagSCMatrix::print(ostream&o) const
 | 
|---|
| 911 | {
 | 
|---|
| 912 |   vprint(0, o, 10);
 | 
|---|
| 913 | }
 | 
|---|
| 914 | 
 | 
|---|
| 915 | void
 | 
|---|
| 916 | DiagSCMatrix::print(const char *t, ostream&o, int i) const
 | 
|---|
| 917 | {
 | 
|---|
| 918 |   vprint(t, o, i);
 | 
|---|
| 919 | }
 | 
|---|
| 920 | 
 | 
|---|
| 921 | void
 | 
|---|
| 922 | DiagSCMatrix::vprint(const char* title, ostream& out, int i) const
 | 
|---|
| 923 | {
 | 
|---|
| 924 |   RefSCMatrix m = kit()->matrix(dim(),dim());
 | 
|---|
| 925 |   m->assign(0.0);
 | 
|---|
| 926 |   m->accumulate(this);
 | 
|---|
| 927 |   m->print(title, out, i);
 | 
|---|
| 928 | }
 | 
|---|
| 929 | 
 | 
|---|
| 930 | DiagSCMatrix*
 | 
|---|
| 931 | DiagSCMatrix::clone()
 | 
|---|
| 932 | {
 | 
|---|
| 933 |   return kit()->diagmatrix(dim());
 | 
|---|
| 934 | }
 | 
|---|
| 935 | 
 | 
|---|
| 936 | DiagSCMatrix*
 | 
|---|
| 937 | DiagSCMatrix::copy()
 | 
|---|
| 938 | {
 | 
|---|
| 939 |   DiagSCMatrix* result = clone();
 | 
|---|
| 940 |   result->assign(this);
 | 
|---|
| 941 |   return result;
 | 
|---|
| 942 | }
 | 
|---|
| 943 | 
 | 
|---|
| 944 | Ref<MessageGrp>
 | 
|---|
| 945 | DiagSCMatrix::messagegrp() const
 | 
|---|
| 946 | {
 | 
|---|
| 947 |   return kit_->messagegrp();
 | 
|---|
| 948 | }
 | 
|---|
| 949 | 
 | 
|---|
| 950 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 951 | // These member are used by the abstract SCVector classes.
 | 
|---|
| 952 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 953 | 
 | 
|---|
| 954 | static ClassDesc SCVector_cd(
 | 
|---|
| 955 |   typeid(SCVector),"SCVector",1,"public DescribedClass",
 | 
|---|
| 956 |   0, 0, 0);
 | 
|---|
| 957 | 
 | 
|---|
| 958 | SCVector::SCVector(const RefSCDimension&a, SCMatrixKit *kit):
 | 
|---|
| 959 |   d(a),
 | 
|---|
| 960 |   kit_(kit)
 | 
|---|
| 961 | {
 | 
|---|
| 962 | }
 | 
|---|
| 963 | 
 | 
|---|
| 964 | SCVector::~SCVector()
 | 
|---|
| 965 | {
 | 
|---|
| 966 | }
 | 
|---|
| 967 | 
 | 
|---|
| 968 | void
 | 
|---|
| 969 | SCVector::save(StateOut&s)
 | 
|---|
| 970 | {
 | 
|---|
| 971 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 972 |   s.put(nr);
 | 
|---|
| 973 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 974 |       s.put(get_element(i));
 | 
|---|
| 975 |     }
 | 
|---|
| 976 | }
 | 
|---|
| 977 | 
 | 
|---|
| 978 | void
 | 
|---|
| 979 | SCVector::restore(StateIn& s)
 | 
|---|
| 980 | {
 | 
|---|
| 981 |   int nrt, nr = n();
 | 
|---|
| 982 |   s.get(nrt);
 | 
|---|
| 983 |   if (nrt != nr) {
 | 
|---|
| 984 |       ExEnv::errn() << "SCVector::restore(): bad dimension" << endl;
 | 
|---|
| 985 |       abort();
 | 
|---|
| 986 |     }
 | 
|---|
| 987 |   for (int i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 988 |       double tmp;
 | 
|---|
| 989 |       s.get(tmp);
 | 
|---|
| 990 |       set_element(i, tmp);
 | 
|---|
| 991 |     }
 | 
|---|
| 992 | }
 | 
|---|
| 993 | 
 | 
|---|
| 994 | double
 | 
|---|
| 995 | SCVector::maxabs() const
 | 
|---|
| 996 | {
 | 
|---|
| 997 |   Ref<SCElementMaxAbs> op = new SCElementMaxAbs();
 | 
|---|
| 998 |   Ref<SCElementOp> abop = op.pointer();
 | 
|---|
| 999 |   ((SCVector*)this)->element_op(abop);
 | 
|---|
| 1000 |   return op->result();
 | 
|---|
| 1001 | }
 | 
|---|
| 1002 | 
 | 
|---|
| 1003 | void
 | 
|---|
| 1004 | SCVector::randomize()
 | 
|---|
| 1005 | {
 | 
|---|
| 1006 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementRandomize();
 | 
|---|
| 1007 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 1008 | }
 | 
|---|
| 1009 | 
 | 
|---|
| 1010 | void
 | 
|---|
| 1011 | SCVector::assign_val(double a)
 | 
|---|
| 1012 | {
 | 
|---|
| 1013 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAssign(a);
 | 
|---|
| 1014 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 1015 | }
 | 
|---|
| 1016 | 
 | 
|---|
| 1017 | void
 | 
|---|
| 1018 | SCVector::assign_p(const double*a)
 | 
|---|
| 1019 | {
 | 
|---|
| 1020 |   int i;
 | 
|---|
| 1021 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 1022 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 1023 |       set_element(i,a[i]);
 | 
|---|
| 1024 |     }
 | 
|---|
| 1025 | }
 | 
|---|
| 1026 | 
 | 
|---|
| 1027 | void
 | 
|---|
| 1028 | SCVector::convert(SCVector*a)
 | 
|---|
| 1029 | {
 | 
|---|
| 1030 |   assign(0.0);
 | 
|---|
| 1031 |   convert_accumulate(a);
 | 
|---|
| 1032 | }
 | 
|---|
| 1033 | 
 | 
|---|
| 1034 | void
 | 
|---|
| 1035 | SCVector::convert_accumulate(SCVector*a)
 | 
|---|
| 1036 | {
 | 
|---|
| 1037 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementAccumulateSCVector(a);
 | 
|---|
| 1038 |   element_op(op);
 | 
|---|
| 1039 | }
 | 
|---|
| 1040 | 
 | 
|---|
| 1041 | void
 | 
|---|
| 1042 | SCVector::convert(double*a) const
 | 
|---|
| 1043 | {
 | 
|---|
| 1044 |   int i;
 | 
|---|
| 1045 |   int nr = n();
 | 
|---|
| 1046 |   for (i=0; i<nr; i++) {
 | 
|---|
| 1047 |       a[i] = get_element(i);
 | 
|---|
| 1048 |     }
 | 
|---|
| 1049 | }
 | 
|---|
| 1050 | 
 | 
|---|
| 1051 | void
 | 
|---|
| 1052 | SCVector::scale(double a)
 | 
|---|
| 1053 | {
 | 
|---|
| 1054 |   Ref<SCElementOp> op = new SCElementScale(a);
 | 
|---|
| 1055 |   this->element_op(op);
 | 
|---|
| 1056 | }
 | 
|---|
| 1057 | 
 | 
|---|
| 1058 | void
 | 
|---|
| 1059 | SCVector::assign_v(SCVector*a)
 | 
|---|
| 1060 | {
 | 
|---|
| 1061 |   this->assign(0.0);
 | 
|---|
| 1062 |   this->accumulate(a);
 | 
|---|
| 1063 | }
 | 
|---|
| 1064 | 
 | 
|---|
| 1065 | void
 | 
|---|
| 1066 | SCVector::print(ostream&o) const
 | 
|---|
| 1067 | {
 | 
|---|
| 1068 |   vprint(0, o, 10);
 | 
|---|
| 1069 | }
 | 
|---|
| 1070 | 
 | 
|---|
| 1071 | void
 | 
|---|
| 1072 | SCVector::print(const char *t, ostream&o, int i) const
 | 
|---|
| 1073 | {
 | 
|---|
| 1074 |   vprint(t, o, i);
 | 
|---|
| 1075 | }
 | 
|---|
| 1076 | 
 | 
|---|
| 1077 | void
 | 
|---|
| 1078 | SCVector::normalize()
 | 
|---|
| 1079 | {
 | 
|---|
| 1080 |   double norm = sqrt(scalar_product(this));
 | 
|---|
| 1081 |   if (norm > 1.e-20) norm = 1.0/norm;
 | 
|---|
| 1082 |   else {
 | 
|---|
| 1083 |       ExEnv::errn() << indent
 | 
|---|
| 1084 |            << "SCVector::normalize: tried to normalize tiny vector\n";
 | 
|---|
| 1085 |       abort();
 | 
|---|
| 1086 |     }
 | 
|---|
| 1087 |   scale(norm);
 | 
|---|
| 1088 | }
 | 
|---|
| 1089 | 
 | 
|---|
| 1090 | SCVector*
 | 
|---|
| 1091 | SCVector::clone()
 | 
|---|
| 1092 | {
 | 
|---|
| 1093 |   return kit()->vector(dim());
 | 
|---|
| 1094 | }
 | 
|---|
| 1095 | 
 | 
|---|
| 1096 | SCVector*
 | 
|---|
| 1097 | SCVector::copy()
 | 
|---|
| 1098 | {
 | 
|---|
| 1099 |   SCVector* result = clone();
 | 
|---|
| 1100 |   result->assign(this);
 | 
|---|
| 1101 |   return result;
 | 
|---|
| 1102 | }
 | 
|---|
| 1103 | 
 | 
|---|
| 1104 | void
 | 
|---|
| 1105 | SCVector::accumulate_product_sv(SymmSCMatrix *m, SCVector *v)
 | 
|---|
| 1106 | {
 | 
|---|
| 1107 |   RefSCMatrix mrect = kit()->matrix(m->dim(),m->dim());
 | 
|---|
| 1108 |   mrect->assign(0.0);
 | 
|---|
| 1109 |   mrect->accumulate(m);
 | 
|---|
| 1110 |   accumulate_product(mrect.pointer(), v);
 | 
|---|
| 1111 | }
 | 
|---|
| 1112 | 
 | 
|---|
| 1113 | Ref<MessageGrp>
 | 
|---|
| 1114 | SCVector::messagegrp() const
 | 
|---|
| 1115 | {
 | 
|---|
| 1116 |   return kit_->messagegrp();
 | 
|---|
| 1117 | }
 | 
|---|
| 1118 | 
 | 
|---|
| 1119 | /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
| 1120 | 
 | 
|---|
| 1121 | // Local Variables:
 | 
|---|
| 1122 | // mode: c++
 | 
|---|
| 1123 | // c-file-style: "CLJ"
 | 
|---|
| 1124 | // End:
 | 
|---|