| [1c51c8] | 1 | /*
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| 2 | * MoleculeDescriptor.cpp
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| 3 | *
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| 4 | * Created on: Feb 5, 2010
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| 5 | * Author: crueger
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| 6 | */
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| 7 |
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| 8 | #include "Descriptors/MoleculeDescriptor.hpp"
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| 9 | #include "Descriptors/MoleculeDescriptor_impl.hpp"
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| 10 |
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|---|
| 11 | #include "World.hpp"
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| 12 |
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| 13 | #include "molecule.hpp"
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| 14 |
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|---|
| 15 | #include <boost/bind.hpp>
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|---|
| 16 | #include <cassert>
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|---|
| 17 | #include <iostream>
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| 18 |
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|---|
| 19 | using namespace std;
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|---|
| 20 |
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|---|
| 21 | typedef World::MoleculeSet::iterator molecules_iter_t;
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|---|
| 22 |
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|---|
| 23 | /************************ Forwarding object **************************************/
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|---|
| 24 |
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|---|
| 25 |
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|---|
| 26 | MoleculeDescriptor::MoleculeDescriptor(impl_ptr _impl) :
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|---|
| 27 | impl(_impl)
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|---|
| 28 | {}
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|---|
| 29 |
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|---|
| 30 | MoleculeDescriptor::MoleculeDescriptor(const MoleculeDescriptor& src) :
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|---|
| 31 | impl(src.get_impl())
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|---|
| 32 | {}
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|---|
| 33 |
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|---|
| 34 | MoleculeDescriptor::~MoleculeDescriptor()
|
|---|
| 35 | {}
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|---|
| 36 |
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|---|
| 37 | MoleculeDescriptor& MoleculeDescriptor::operator=(MoleculeDescriptor &src){
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|---|
| 38 | if(&src!=this) {
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|---|
| 39 | impl=src.get_impl();
|
|---|
| 40 | }
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|---|
| 41 | return *this;
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|---|
| 42 | }
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|---|
| 43 |
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|---|
| 44 | molecule* MoleculeDescriptor::find(){
|
|---|
| 45 | return impl->find();
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|---|
| 46 | }
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|---|
| 47 |
|
|---|
| 48 | std::vector<molecule*> MoleculeDescriptor::findAll(){
|
|---|
| 49 | return impl->findAll();
|
|---|
| 50 | }
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|---|
| 51 |
|
|---|
| 52 | MoleculeDescriptor::impl_ptr MoleculeDescriptor::get_impl() const{
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|---|
| 53 | return impl;
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|---|
| 54 | }
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|---|
| 55 |
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|---|
| 56 |
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|---|
| 57 |
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|---|
| 58 |
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|---|
| 59 | /**************************** implementation ********************/
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|---|
| 60 |
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|---|
| 61 | MoleculeDescriptor_impl::MoleculeDescriptor_impl()
|
|---|
| 62 | {
|
|---|
| 63 | }
|
|---|
| 64 |
|
|---|
| 65 | MoleculeDescriptor_impl::~MoleculeDescriptor_impl()
|
|---|
| 66 | {
|
|---|
| 67 | }
|
|---|
| 68 |
|
|---|
| 69 | World::MoleculeSet& MoleculeDescriptor_impl::getMolecules(){
|
|---|
| [23b547] | 70 | return World::getInstance().molecules;
|
|---|
| [1c51c8] | 71 | }
|
|---|
| 72 |
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|---|
| 73 | molecule* MoleculeDescriptor_impl::find() {
|
|---|
| 74 | World::MoleculeSet molecules = getMolecules();
|
|---|
| 75 | molecules_iter_t res = find_if(molecules.begin(),molecules.end(),boost::bind(&MoleculeDescriptor_impl::predicate,this,_1));
|
|---|
| 76 | return (res!=molecules.end())?((*res).second):0;
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|---|
| 77 | }
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|---|
| 78 |
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|---|
| 79 | vector<molecule*> MoleculeDescriptor_impl::findAll() {
|
|---|
| 80 | vector<molecule*> res;
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|---|
| 81 | World::MoleculeSet molecules = getMolecules();
|
|---|
| 82 | molecules_iter_t iter;
|
|---|
| 83 | for(iter=molecules.begin();iter!=molecules.end();++iter) {
|
|---|
| 84 | if(predicate(*iter)){
|
|---|
| 85 | res.push_back((*iter).second);
|
|---|
| 86 | }
|
|---|
| 87 | }
|
|---|
| 88 | return res;
|
|---|
| 89 | }
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|---|
| 90 |
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|---|
| 91 | /************************** Universe and Emptyset *****************/
|
|---|
| 92 |
|
|---|
| 93 | MoleculeAllDescriptor_impl::MoleculeAllDescriptor_impl()
|
|---|
| 94 | {}
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|---|
| 95 |
|
|---|
| 96 | MoleculeAllDescriptor_impl::~MoleculeAllDescriptor_impl()
|
|---|
| 97 | {}
|
|---|
| 98 |
|
|---|
| 99 | bool MoleculeAllDescriptor_impl::predicate(std::pair<moleculeId_t,molecule*>){
|
|---|
| 100 | return true;
|
|---|
| 101 | }
|
|---|
| 102 |
|
|---|
| 103 | MoleculeDescriptor AllMolecules(){
|
|---|
| 104 | return MoleculeDescriptor(MoleculeDescriptor::impl_ptr(new MoleculeAllDescriptor_impl));
|
|---|
| 105 | }
|
|---|
| 106 |
|
|---|
| 107 | MoleculeNoneDescriptor_impl::MoleculeNoneDescriptor_impl()
|
|---|
| 108 | {}
|
|---|
| 109 |
|
|---|
| 110 | MoleculeNoneDescriptor_impl::~MoleculeNoneDescriptor_impl()
|
|---|
| 111 | {}
|
|---|
| 112 |
|
|---|
| 113 | bool MoleculeNoneDescriptor_impl::predicate(std::pair<moleculeId_t,molecule*>){
|
|---|
| 114 | return false;
|
|---|
| 115 | }
|
|---|
| 116 |
|
|---|
| 117 | MoleculeDescriptor NoMolecules(){
|
|---|
| 118 | return MoleculeDescriptor(MoleculeDescriptor::impl_ptr(new MoleculeNoneDescriptor_impl));
|
|---|
| 119 | }
|
|---|
| 120 |
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|---|
| 121 | /************************** Operator stuff ************************/
|
|---|
| 122 |
|
|---|
| 123 | // AND
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|---|
| 124 | MoleculeAndDescriptor_impl::MoleculeAndDescriptor_impl(MoleculeDescriptor::impl_ptr _lhs, MoleculeDescriptor::impl_ptr _rhs) :
|
|---|
| 125 | lhs(_lhs), rhs(_rhs)
|
|---|
| 126 | {}
|
|---|
| 127 |
|
|---|
| 128 | MoleculeAndDescriptor_impl::~MoleculeAndDescriptor_impl()
|
|---|
| 129 | {}
|
|---|
| 130 |
|
|---|
| 131 | bool MoleculeAndDescriptor_impl::predicate(std::pair<moleculeId_t,molecule*> molecule){
|
|---|
| 132 | return lhs->predicate(molecule) && rhs->predicate(molecule);
|
|---|
| 133 | }
|
|---|
| 134 | MoleculeDescriptor operator&&(const MoleculeDescriptor &lhs, const MoleculeDescriptor &rhs){
|
|---|
| 135 | MoleculeDescriptor::impl_ptr newImpl = MoleculeDescriptor::impl_ptr(new MoleculeAndDescriptor_impl(lhs.get_impl(),rhs.get_impl()));
|
|---|
| 136 | return MoleculeDescriptor(newImpl);
|
|---|
| 137 | }
|
|---|
| 138 |
|
|---|
| 139 | // OR
|
|---|
| 140 | MoleculeOrDescriptor_impl::MoleculeOrDescriptor_impl(MoleculeDescriptor::impl_ptr _lhs ,MoleculeDescriptor::impl_ptr _rhs) :
|
|---|
| 141 | lhs(_lhs), rhs(_rhs)
|
|---|
| 142 | {}
|
|---|
| 143 |
|
|---|
| 144 | MoleculeOrDescriptor_impl::~MoleculeOrDescriptor_impl(){
|
|---|
| 145 | }
|
|---|
| 146 |
|
|---|
| 147 | bool MoleculeOrDescriptor_impl::predicate(std::pair<moleculeId_t,molecule*> molecule){
|
|---|
| 148 | return lhs->predicate(molecule) || rhs->predicate(molecule);
|
|---|
| 149 | }
|
|---|
| 150 |
|
|---|
| 151 | MoleculeDescriptor operator||(const MoleculeDescriptor &lhs, const MoleculeDescriptor &rhs){
|
|---|
| 152 | MoleculeDescriptor::impl_ptr newImpl = MoleculeDescriptor::impl_ptr(new MoleculeOrDescriptor_impl(lhs.get_impl(),rhs.get_impl()));
|
|---|
| 153 | return MoleculeDescriptor(newImpl);
|
|---|
| 154 | }
|
|---|
| 155 |
|
|---|
| 156 | // NOT
|
|---|
| 157 |
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|---|
| 158 | MoleculeNotDescriptor_impl::MoleculeNotDescriptor_impl(MoleculeDescriptor::impl_ptr _arg) :
|
|---|
| 159 | arg(_arg)
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|---|
| 160 | {}
|
|---|
| 161 |
|
|---|
| 162 |
|
|---|
| 163 | MoleculeNotDescriptor_impl::~MoleculeNotDescriptor_impl()
|
|---|
| 164 | {
|
|---|
| 165 | }
|
|---|
| 166 |
|
|---|
| 167 | bool MoleculeNotDescriptor_impl::predicate(std::pair<moleculeId_t,molecule*> molecule){
|
|---|
| 168 | return !(arg->predicate(molecule));
|
|---|
| 169 | }
|
|---|
| 170 |
|
|---|
| 171 | MoleculeDescriptor operator!(const MoleculeDescriptor &arg){
|
|---|
| 172 | MoleculeDescriptor::impl_ptr newImpl = MoleculeDescriptor::impl_ptr(new MoleculeNotDescriptor_impl(arg.get_impl()));
|
|---|
| 173 | return MoleculeDescriptor(newImpl);
|
|---|
| 174 | }
|
|---|